103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3962 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  742    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  60.71 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  55.93 
 
 		 351 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  55.49 
 
 		 342 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  57.27 
 
 		 369 aa  391  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  52.74 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  51.56 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  58.88 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  51.81 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  52.68 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  52.41 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  55.41 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  48.78 
 
 		 364 aa  348  9e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  49.85 
 
 		 337 aa  328  7e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  57.56 
 
 		 245 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  42.27 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  46.36 
 
 		 341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  37.9 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  37.9 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  37.1 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  35.48 
 
 		 388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  35.65 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  34.55 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  35.28 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  37.75 
 
 		 341 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  35.78 
 
 		 358 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  37.22 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  37.22 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  37.22 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  34.37 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  32.43 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  32.61 
 
 		 367 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  32.61 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  33.05 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  33.84 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  36.23 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  36.06 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  33.13 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  34.71 
 
 		 359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  37.21 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  33.43 
 
 		 360 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  36.34 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  35.33 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  33.92 
 
 		 345 aa  179  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  35.69 
 
 		 350 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  32.68 
 
 		 389 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  34.43 
 
 		 353 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  35.15 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  33.61 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  29.97 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  30.25 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  34.11 
 
 		 358 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  36.75 
 
 		 347 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  33.75 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  32.86 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  34.45 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  30.52 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  30.7 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  30.08 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  33.82 
 
 		 354 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  30.3 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  30.33 
 
 		 340 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  34.7 
 
 		 368 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  34.83 
 
 		 364 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  34.62 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  35.85 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  30.46 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  33.82 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  33.95 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  32.99 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  33.1 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  33.54 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  31.53 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  31.03 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  28.76 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  38.96 
 
 		 400 aa  149  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  31.46 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  38.79 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  29.01 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  28.88 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  26.69 
 
 		 359 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  28.3 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  30.03 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  29.66 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  26.52 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  35.58 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  30.07 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  44.52 
 
 		 160 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  31.6 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  27.3 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  31.82 
 
 		 217 aa  106  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  28.5 
 
 		 232 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  26.52 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  22.73 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  31.09 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  29.67 
 
 		 159 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  29.67 
 
 		 159 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  29.67 
 
 		 159 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  29.67 
 
 		 136 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0178  hypothetical protein  43.64 
 
 		 56 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>