100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2497 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 		 349 aa  716    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  62.5 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  61.75 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  52.31 
 
 		 335 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  50.62 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  44.11 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  43.77 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  42.55 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  40.13 
 
 		 345 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  41.14 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  36.78 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  40.44 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  69.94 
 
 		 160 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  38.76 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  38.44 
 
 		 369 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  36.65 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  38.35 
 
 		 364 aa  212  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  39.2 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  36.12 
 
 		 358 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  38.85 
 
 		 347 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  37.88 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  35.78 
 
 		 353 aa  206  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  35.56 
 
 		 358 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  39.51 
 
 		 364 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  35.31 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  38.85 
 
 		 361 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  35.83 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  35.19 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  34.97 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  35.94 
 
 		 343 aa  196  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  33.96 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  37.85 
 
 		 368 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  36.75 
 
 		 355 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  37.79 
 
 		 350 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  31.82 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  36.22 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  32.32 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  32.02 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  37.61 
 
 		 351 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  35.8 
 
 		 358 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  33.96 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  36.06 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  32.95 
 
 		 367 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  32.29 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  32.95 
 
 		 367 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  32.95 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  29.43 
 
 		 359 aa  182  6e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  29.88 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  34.02 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  35.63 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  29.8 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  33.71 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  33.54 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  29.55 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  32.57 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  33.43 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  34.35 
 
 		 347 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  36.22 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  33.14 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  33.14 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  33.14 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  30.77 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  27.73 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  33.02 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  31.71 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  35.76 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  35.35 
 
 		 353 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  34.85 
 
 		 351 aa  162  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  30.34 
 
 		 335 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  28.96 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  33.13 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  31.5 
 
 		 345 aa  159  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  30.49 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  32.8 
 
 		 349 aa  155  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  35.41 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  33.23 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  27.71 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  38.46 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  37.74 
 
 		 245 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  28.45 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  28.93 
 
 		 359 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  29.3 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  34.69 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  39.61 
 
 		 371 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  28.93 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  30 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  33.93 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  33.92 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  28.86 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  24.4 
 
 		 407 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  30 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  29.68 
 
 		 387 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  31.03 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  31.69 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  30.84 
 
 		 171 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  31.3 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2446  protein of unknown function DUF1016  28.26 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  36.23 
 
 		 154 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  34.07 
 
 		 120 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  28.93 
 
 		 217 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>