104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0451 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 		 375 aa  771    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  47.31 
 
 		 407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  46.07 
 
 		 389 aa  332  9e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  46.2 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  45.08 
 
 		 400 aa  293  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  46.37 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  45.18 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  40.45 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  44.32 
 
 		 387 aa  286  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  42.94 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  44.51 
 
 		 354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  45.17 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  42.29 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  44.89 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  44.44 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  44.93 
 
 		 350 aa  276  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  42.94 
 
 		 376 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  43.6 
 
 		 349 aa  262  8e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  41.14 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  41.14 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  41.14 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  39.27 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  44.83 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  39.89 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  43.03 
 
 		 333 aa  248  9e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  39.26 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  39.6 
 
 		 375 aa  242  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  39.26 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  39.32 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  38.98 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  38.86 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  38.57 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  38 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  33.8 
 
 		 378 aa  215  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  34.17 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  32.49 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  32.59 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  30.25 
 
 		 353 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  30.25 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  32 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  33.13 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  34.17 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  32.84 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  30.46 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  33.05 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  32.86 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  30.94 
 
 		 342 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  31.27 
 
 		 369 aa  162  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  32.43 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  30.58 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  31.71 
 
 		 354 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  32.87 
 
 		 347 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  31.52 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  32.49 
 
 		 358 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  30.34 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  32.7 
 
 		 347 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  32.23 
 
 		 347 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  32.29 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  30.67 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  33.43 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  40.97 
 
 		 217 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  35.02 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  28.46 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  29.81 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  29.92 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  29.78 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  31.61 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  28.92 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  30.08 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  31.67 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  30.22 
 
 		 359 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  30.32 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  29.3 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  35.91 
 
 		 245 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  33.24 
 
 		 344 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  33.76 
 
 		 264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  29.2 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  29.6 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  30.32 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  27.1 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  30.52 
 
 		 335 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  27.27 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  28.66 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  29.89 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  29.36 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  24.11 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  26.84 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  25.86 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  27.02 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  34.25 
 
 		 235 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  28.75 
 
 		 354 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  31.6 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  41.67 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  41.67 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  41.67 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  42.06 
 
 		 136 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  28.81 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1738  hypothetical protein  53.57 
 
 		 70 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  48.53 
 
 		 71 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>