82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4509 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  45.57 
 
 		 370 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  40.74 
 
 		 384 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  40.09 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  40.69 
 
 		 371 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  36.29 
 
 		 378 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  34.26 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  34.4 
 
 		 400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  34.25 
 
 		 375 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  32.88 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  33.94 
 
 		 389 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  33.61 
 
 		 378 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  34.98 
 
 		 378 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  34.98 
 
 		 378 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  32.89 
 
 		 341 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  32.14 
 
 		 387 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  31.7 
 
 		 387 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  33.79 
 
 		 361 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  29.74 
 
 		 349 aa  95.5  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 367 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  30.43 
 
 		 407 aa  90.5  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  30.36 
 
 		 388 aa  90.1  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  32.68 
 
 		 375 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  29.91 
 
 		 339 aa  89  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  28.14 
 
 		 335 aa  89  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  32.88 
 
 		 367 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  30.37 
 
 		 389 aa  88.2  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  29.57 
 
 		 367 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  29.44 
 
 		 345 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  31.88 
 
 		 349 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  31.78 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  32.22 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  30.54 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  26.69 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  30.08 
 
 		 354 aa  75.5  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  25.11 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  27.03 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  27.16 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  28.76 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  26.79 
 
 		 364 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  27.62 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  24.46 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  26.7 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  22.73 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  25.11 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  25.47 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  31.82 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  26.09 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  25.91 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  26.89 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  23.48 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  25.66 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  26.83 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  39.02 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  39.02 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  39.02 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  39.02 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  31.31 
 
 		 337 aa  52.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  41.67 
 
 		 71 aa  52.4  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  26.79 
 
 		 358 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  24.44 
 
 		 358 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  26.34 
 
 		 339 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  25.11 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  29.29 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  22.69 
 
 		 342 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  26.64 
 
 		 354 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  22.41 
 
 		 347 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  25.94 
 
 		 338 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  25.54 
 
 		 348 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  25.54 
 
 		 360 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2474  hypothetical protein  36.59 
 
 		 104 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  24.29 
 
 		 381 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  24.46 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  22.22 
 
 		 357 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  23.67 
 
 		 381 aa  46.2  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3548  hypothetical protein  35.38 
 
 		 72 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.936527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1738  hypothetical protein  44.64 
 
 		 70 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243517 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  25.11 
 
 		 361 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  28.33 
 
 		 167 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  30.39 
 
 		 349 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  23.67 
 
 		 347 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>