102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1562 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  763    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  63.3 
 
 		 384 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  61.31 
 
 		 376 aa  441  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  53.41 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  46.32 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  38.52 
 
 		 375 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  36.94 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  37.77 
 
 		 387 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  37.77 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  35.58 
 
 		 387 aa  229  7e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  35.23 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  36.51 
 
 		 389 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  36.62 
 
 		 340 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  36.67 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  36.67 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  36.67 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  36.12 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  36.93 
 
 		 375 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  35.47 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  38.03 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  35.22 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  35.71 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  36.66 
 
 		 375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  35.73 
 
 		 367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  35.46 
 
 		 361 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  35.28 
 
 		 345 aa  210  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  36.78 
 
 		 341 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  35.8 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  36.9 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  37.07 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  33.51 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  34.01 
 
 		 350 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  32.86 
 
 		 339 aa  185  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  32.67 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  35.39 
 
 		 351 aa  182  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  33.7 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  34.88 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  34.24 
 
 		 356 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  32.86 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  31.2 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  35.28 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  32.94 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  31.69 
 
 		 369 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  34.18 
 
 		 358 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  33.43 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  40.69 
 
 		 235 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  31.98 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  32.57 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  40 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  33.71 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  31.34 
 
 		 347 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  39.91 
 
 		 245 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  32.32 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  38.46 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  31.89 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  32.13 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  42 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  32.25 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  29.83 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  29.66 
 
 		 361 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  33.14 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  30.61 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  33.03 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  29.25 
 
 		 357 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  30.51 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  29.89 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  38.91 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  31.31 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  30.41 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  30.22 
 
 		 335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  28.34 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  29.46 
 
 		 359 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  39.61 
 
 		 349 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  37.33 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  29.19 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  29.08 
 
 		 368 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  39.58 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  28.25 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  29.23 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  29.21 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  29.85 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  34.26 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  28.96 
 
 		 353 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  28.39 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  28.65 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  28.93 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  28.81 
 
 		 345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  27.22 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  39.31 
 
 		 160 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  29.87 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  37.95 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  25.27 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  30.6 
 
 		 217 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0058  hypothetical protein  60.56 
 
 		 119 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2474  hypothetical protein  43.82 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  25.1 
 
 		 232 aa  53.1  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1716  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000229977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  32.58 
 
 		 136 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  32.58 
 
 		 159 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  32.58 
 
 		 159 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>