32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0058 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0058  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  248  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  60.56 
 
 		 371 aa  88.6  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  61.19 
 
 		 384 aa  86.3  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  58.93 
 
 		 376 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  53.7 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  48.15 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  49.02 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  44.83 
 
 		 340 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  38.18 
 
 		 389 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  45.76 
 
 		 400 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  31.58 
 
 		 375 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  44.19 
 
 		 387 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  33.87 
 
 		 407 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  44.19 
 
 		 387 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  37.5 
 
 		 345 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  44.19 
 
 		 389 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  44.19 
 
 		 388 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  34.85 
 
 		 333 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  53.85 
 
 		 349 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  42.22 
 
 		 339 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  40.48 
 
 		 375 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  40.48 
 
 		 375 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  32.26 
 
 		 359 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  40.48 
 
 		 349 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1668  hypothetical protein  27.63 
 
 		 79 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0154948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  39.53 
 
 		 378 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  39.53 
 
 		 378 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  43.48 
 
 		 358 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  42.55 
 
 		 382 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  39.53 
 
 		 378 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  41.03 
 
 		 350 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  36.99 
 
 		 348 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>