More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4502 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3158  glucose-methanol-choline oxidoreductase  94.97 
 
 		 537 aa  1055    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0331  GMC oxidoreductase  77.65 
 
 		 557 aa  876    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 537 aa  1106    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4030  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.69 
 
 		 534 aa  704    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0557  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.44 
 
 		 535 aa  675    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4997  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.04 
 
 		 532 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3138  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.04 
 
 		 532 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3144  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.5 
 
 		 521 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0054  GMC oxidoreductase  49.72 
 
 		 556 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  50.09 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  50.09 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  50.09 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2659  GMC oxidoreductase  49.53 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1833  GMC oxidoreductase  49.53 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3294  GMC oxidoreductase  49.53 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2719  GMC oxidoreductase  49.53 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3525  putative glucose-methanol-choline (GMC)oxidoreductase  45.3 
 
 		 534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4456  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.98 
 
 		 531 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691807  normal  0.0210476 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.98 
 
 		 542 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  44.69 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.93 
 
 		 537 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  42.62 
 
 		 574 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.09 
 
 		 540 aa  395  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.57 
 
 		 563 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.54 
 
 		 552 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  44.14 
 
 		 557 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  41.04 
 
 		 556 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.45 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.71 
 
 		 532 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.83 
 
 		 530 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  40.93 
 
 		 561 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2223  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.4 
 
 		 531 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487572  normal  0.417914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  41.12 
 
 		 572 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.09 
 
 		 541 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  40.71 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  41.82 
 
 		 559 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.7 
 
 		 539 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2450  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.82 
 
 		 554 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.389651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.02 
 
 		 541 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.1 
 
 		 537 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  43.04 
 
 		 551 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0572  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.95 
 
 		 531 aa  382  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0931268  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  42.08 
 
 		 559 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.67 
 
 		 550 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  40.4 
 
 		 565 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.62 
 
 		 536 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  42.24 
 
 		 559 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  40.66 
 
 		 565 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  43.81 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.78 
 
 		 539 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  42.8 
 
 		 551 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.84 
 
 		 531 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  39.96 
 
 		 561 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  43.76 
 
 		 1290 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  44.03 
 
 		 531 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  39.96 
 
 		 561 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  42.09 
 
 		 570 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  39.96 
 
 		 561 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  39.96 
 
 		 561 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4183  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.84 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  40.3 
 
 		 564 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  39.93 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  41.08 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0443  choline dehydrogenase  41.68 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4732  choline dehydrogenase  41.5 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0203  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  42.75 
 
 		 559 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  39.63 
 
 		 562 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.53 
 
 		 556 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1383  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.12 
 
 		 551 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00471975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  42.65 
 
 		 553 aa  372  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6848  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.39 
 
 		 556 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.53 
 
 		 556 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 		 550 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1582  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.88 
 
 		 533 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.3 
 
 		 546 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.31 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.59 
 
 		 548 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  41.04 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  39.89 
 
 		 560 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0884  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.18 
 
 		 553 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.275807  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  40.56 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  41.04 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  39.63 
 
 		 549 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  40.86 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2716  putative GMC oxidoreductase  43.25 
 
 		 562 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1144  choline dehydrogenase  39.55 
 
 		 551 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  40.55 
 
 		 556 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.72 
 
 		 576 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1492  choline dehydrogenase  41.74 
 
 		 556 aa  363  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.7 
 
 		 538 aa  364  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.65 
 
 		 552 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  41.23 
 
 		 544 aa  363  4e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.37 
 
 		 576 aa  363  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0670  GMC family oxidoreductase  38.69 
 
 		 534 aa  362  7.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  41.53 
 
 		 546 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  41.91 
 
 		 554 aa  362  9e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.16 
 
 		 560 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.04 
 
 		 535 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1949  GMC family oxidoreductase  39.26 
 
 		 550 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0586145  unclonable  0.000000512241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.67 
 
 		 571 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>