More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0669 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0669  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
225 aa  454  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000493752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 
217 aa  205  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
229 aa  200  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.98 
 
 
225 aa  194  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.45 
 
 
221 aa  194  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0833  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.93 
 
 
216 aa  194  7e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
221 aa  193  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
221 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
221 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
217 aa  191  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.92 
 
 
217 aa  191  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.13 
 
 
224 aa  191  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.52 
 
 
231 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0481  ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 
215 aa  189  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0481  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.26 
 
 
242 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.29 
 
 
230 aa  188  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.59 
 
 
220 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
221 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.28 
 
 
219 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
219 aa  185  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.19 
 
 
215 aa  185  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
221 aa  184  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  43 
 
 
218 aa  184  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
224 aa  184  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.93 
 
 
222 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2057  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.725106 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.83 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.52 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.63 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.63 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.63 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.63 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.61 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.63 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.63 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.87 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.63 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.12 
 
 
214 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.63 
 
 
234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
221 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.18 
 
 
224 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.18 
 
 
224 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.18 
 
 
224 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
225 aa  181  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.2 
 
 
225 aa  180  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.18 
 
 
225 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.58 
 
 
219 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0977  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.65 
 
 
219 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.65 
 
 
214 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.02 
 
 
235 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5109  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.45 
 
 
215 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0277689  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2395  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.46 
 
 
221 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.51 
 
 
224 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  38.65 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.57 
 
 
220 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.75 
 
 
223 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  37.73 
 
 
224 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.72 
 
 
225 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.65 
 
 
218 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.65 
 
 
214 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.55 
 
 
216 aa  178  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.42 
 
 
220 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.54 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.81 
 
 
223 aa  178  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  39.91 
 
 
224 aa  178  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.11 
 
 
224 aa  178  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.44 
 
 
225 aa  177  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.58 
 
 
221 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0788  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.03 
 
 
214 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.68 
 
 
220 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0743  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.97 
 
 
226 aa  177  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000598804 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1205  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.32 
 
 
211 aa  177  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.58 
 
 
223 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0648  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.18 
 
 
234 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.15 
 
 
234 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1653  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 
217 aa  176  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.123054 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0651  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.11 
 
 
221 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.31 
 
 
217 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.16 
 
 
228 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1322  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.24 
 
 
220 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.307834  hitchhiker  0.00000000745159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
219 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.04 
 
 
241 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.72 
 
 
221 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.17 
 
 
264 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.18 
 
 
220 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.22 
 
 
220 aa  175  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.54 
 
 
221 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0333  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.76 
 
 
216 aa  175  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.540612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  39.71 
 
 
217 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.71 
 
 
223 aa  175  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.83 
 
 
223 aa  175  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0231785  normal  0.0116458 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0165  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.18 
 
 
224 aa  174  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  43 
 
 
227 aa  175  7e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 
235 aa  174  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.33 
 
 
238 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.16 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.48 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.65 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>