More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1957 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2395  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.61 
 
 		 221 aa  288  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  64.15 
 
 		 217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.33 
 
 		 222 aa  272  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0481  Ribulose-phosphate 3-epimerase  59.63 
 
 		 242 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0977  Ribulose-phosphate 3-epimerase  61.5 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213833 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.85 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.06 
 
 		 220 aa  241  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.37 
 
 		 234 aa  238  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.25 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.25 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.61 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.38 
 
 		 217 aa  234  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.17 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 		 221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 		 221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.9 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 		 235 aa  231  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.83 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.05 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  49.77 
 
 		 265 aa  229  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.81 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 		 231 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.46 
 
 		 264 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 		 217 aa  227  9e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.64 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.19 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.14 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.64 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.55 
 
 		 223 aa  225  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.21 
 
 		 221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.72 
 
 		 211 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 		 220 aa  224  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.33 
 
 		 219 aa  224  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.72 
 
 		 224 aa  223  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.18 
 
 		 233 aa  222  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.9 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 		 229 aa  221  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.6 
 
 		 221 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.02 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.11 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.11 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.8 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3176  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.18 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.5 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.82 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 		 216 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.99 
 
 		 220 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.39 
 
 		 221 aa  218  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.95 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  50.7 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.73 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0267  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.28 
 
 		 222 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.137082  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.21 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.28 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2292  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.03 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0049  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.83 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.26 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.52 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.75 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 243 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.05 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.28 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.72 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.88 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.72 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  215  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.64 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.8 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.03 
 
 		 214 aa  215  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.64 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.64 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.33 
 
 		 222 aa  215  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  214  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.47 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 		 221 aa  214  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.28 
 
 		 224 aa  214  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0327  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204958  normal  0.201128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>