More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_09961 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  89.55 
 
 		 264 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  90.28 
 
 		 227 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  86.7 
 
 		 221 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  80 
 
 		 247 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  76.02 
 
 		 238 aa  353  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  76.47 
 
 		 234 aa  352  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  76.47 
 
 		 234 aa  352  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  75.57 
 
 		 235 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  74.66 
 
 		 235 aa  345  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.42 
 
 		 235 aa  340  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.76 
 
 		 236 aa  340  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  66.97 
 
 		 265 aa  317  9e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.85 
 
 		 214 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.38 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  60 
 
 		 221 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.43 
 
 		 214 aa  261  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 		 214 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  62.38 
 
 		 221 aa  256  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  61.32 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  61.32 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.72 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.55 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 		 220 aa  251  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.08 
 
 		 230 aa  251  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.08 
 
 		 218 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.65 
 
 		 221 aa  251  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 		 220 aa  251  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 		 220 aa  251  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.8 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.01 
 
 		 221 aa  248  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.19 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.5 
 
 		 223 aa  245  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.41 
 
 		 233 aa  245  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  53.81 
 
 		 224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.27 
 
 		 224 aa  241  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.3 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.21 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.54 
 
 		 221 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 		 224 aa  236  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.88 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.72 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.4 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 		 219 aa  236  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 219 aa  234  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.56 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.83 
 
 		 222 aa  232  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.8 
 
 		 216 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 		 223 aa  231  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.8 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  53 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2218  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.2 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 221 aa  229  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 227 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.58 
 
 		 243 aa  228  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.45 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 		 222 aa  228  6e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2874  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 		 224 aa  228  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.7 
 
 		 225 aa  227  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.17 
 
 		 221 aa  227  9e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.95 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.68 
 
 		 228 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.6 
 
 		 225 aa  226  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.44 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.68 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.68 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.68 
 
 		 228 aa  225  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.67 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2057  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.58 
 
 		 231 aa  225  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.725106 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.13 
 
 		 227 aa  225  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.55 
 
 		 239 aa  225  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.93 
 
 		 219 aa  225  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3494  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.04 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00334689  hitchhiker  0.000085645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 228 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3689  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.88 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.6 
 
 		 227 aa  224  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 		 221 aa  224  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.69 
 
 		 225 aa  224  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.69 
 
 		 225 aa  224  8e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.69 
 
 		 225 aa  224  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5332  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.7 
 
 		 233 aa  223  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137752  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2786  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.05 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0449  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0446  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0415  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3573  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.58 
 
 		 243 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>