More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3613 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  78.28 
 
 		 221 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  78.28 
 
 		 221 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  84.16 
 
 		 221 aa  362  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  82.81 
 
 		 221 aa  354  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  81.9 
 
 		 221 aa  348  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  78.28 
 
 		 221 aa  345  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  72.3 
 
 		 221 aa  322  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  68.1 
 
 		 247 aa  298  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.67 
 
 		 235 aa  293  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.2 
 
 		 238 aa  291  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.92 
 
 		 236 aa  290  8e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.73 
 
 		 235 aa  287  8e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.84 
 
 		 224 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.42 
 
 		 230 aa  281  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.9 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.5 
 
 		 221 aa  280  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.98 
 
 		 227 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.95 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  64.95 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.87 
 
 		 234 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.87 
 
 		 234 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.22 
 
 		 219 aa  276  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.16 
 
 		 214 aa  276  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.53 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.16 
 
 		 214 aa  275  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.16 
 
 		 214 aa  275  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.16 
 
 		 214 aa  275  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.16 
 
 		 214 aa  275  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.16 
 
 		 214 aa  275  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.16 
 
 		 214 aa  275  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.16 
 
 		 214 aa  275  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.97 
 
 		 220 aa  275  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.68 
 
 		 214 aa  274  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.2 
 
 		 214 aa  274  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  63.76 
 
 		 224 aa  274  9e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  63.76 
 
 		 224 aa  274  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.68 
 
 		 214 aa  272  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.33 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.75 
 
 		 218 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.38 
 
 		 221 aa  271  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.24 
 
 		 220 aa  270  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.72 
 
 		 224 aa  269  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.68 
 
 		 219 aa  269  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  60.85 
 
 		 265 aa  268  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 224 aa  264  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.69 
 
 		 222 aa  264  8.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.62 
 
 		 223 aa  263  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 		 221 aa  262  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  59.72 
 
 		 224 aa  261  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.33 
 
 		 232 aa  257  9e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.9 
 
 		 222 aa  254  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.01 
 
 		 218 aa  254  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.54 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  58 
 
 		 220 aa  251  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.45 
 
 		 234 aa  251  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.98 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.62 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0350  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.84 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.027158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0361  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.84 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.67 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.4 
 
 		 230 aa  245  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 		 228 aa  245  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.22 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.74 
 
 		 228 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.69 
 
 		 219 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.74 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.74 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.4 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.4 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.74 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.4 
 
 		 225 aa  242  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.92 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.4 
 
 		 225 aa  242  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.14 
 
 		 225 aa  241  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.74 
 
 		 228 aa  241  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1911  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.77 
 
 		 230 aa  241  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.822201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.67 
 
 		 225 aa  241  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 		 224 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.81 
 
 		 227 aa  241  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 		 224 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 		 224 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1510  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.89 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000472426  decreased coverage  0.0000666279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.92 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.27 
 
 		 225 aa  240  2e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.53 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.25 
 
 		 224 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2786  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.72 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.87 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2874  ribulose-phosphate 3-epimerase  60 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.25 
 
 		 221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0082  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 		 228 aa  238  5e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.67 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0924  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.25 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.92 
 
 		 223 aa  237  9e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.52 
 
 		 217 aa  236  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0267  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.5 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.137082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.5 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>