More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3971 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
224 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  96.41 
 
 
224 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  96.41 
 
 
224 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  86.19 
 
 
230 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.52 
 
 
236 aa  288  6e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.06 
 
 
235 aa  285  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.19 
 
 
235 aa  284  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.59 
 
 
235 aa  283  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.29 
 
 
247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.68 
 
 
234 aa  281  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.68 
 
 
234 aa  281  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.55 
 
 
227 aa  279  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.41 
 
 
221 aa  276  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.41 
 
 
221 aa  276  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.68 
 
 
238 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  62.84 
 
 
221 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.72 
 
 
221 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
220 aa  270  9e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.93 
 
 
221 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.33 
 
 
221 aa  268  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 
221 aa  268  5e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.74 
 
 
221 aa  266  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 
221 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
214 aa  265  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
214 aa  265  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
214 aa  265  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
214 aa  265  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
214 aa  265  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
214 aa  265  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
214 aa  265  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
214 aa  265  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
214 aa  265  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.02 
 
 
219 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.69 
 
 
214 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
214 aa  263  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.38 
 
 
229 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.56 
 
 
221 aa  261  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.53 
 
 
218 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.48 
 
 
221 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.96 
 
 
226 aa  255  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.08 
 
 
224 aa  255  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  55.45 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 
218 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.5 
 
 
225 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.44 
 
 
227 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.09 
 
 
232 aa  246  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  57.79 
 
 
224 aa  246  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.56 
 
 
227 aa  245  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.5 
 
 
233 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.27 
 
 
225 aa  245  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.98 
 
 
222 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.41 
 
 
225 aa  244  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.39 
 
 
225 aa  244  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
216 aa  244  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 
222 aa  244  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.34 
 
 
219 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.42 
 
 
221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 
219 aa  242  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.17 
 
 
224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.17 
 
 
231 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.77 
 
 
234 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 
220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 
220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.56 
 
 
227 aa  237  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.93 
 
 
219 aa  237  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.31 
 
 
243 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.56 
 
 
223 aa  235  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.38 
 
 
230 aa  234  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4340  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.5 
 
 
232 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 
223 aa  234  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.42 
 
 
225 aa  232  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2075  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.67 
 
 
224 aa  232  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.45 
 
 
228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1771  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 
232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2572  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.3 
 
 
244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.712481  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.56 
 
 
217 aa  231  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.42 
 
 
239 aa  231  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.28 
 
 
215 aa  229  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.29 
 
 
243 aa  229  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.13 
 
 
224 aa  229  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
224 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.75 
 
 
228 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.14 
 
 
229 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1512  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.41 
 
 
236 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.659208  normal  0.0217297 
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.2 
 
 
225 aa  228  4e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.54 
 
 
225 aa  228  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0005  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.27 
 
 
223 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591326  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.75 
 
 
228 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.8 
 
 
225 aa  228  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2874  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.42 
 
 
224 aa  228  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.75 
 
 
228 aa  228  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.75 
 
 
228 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.75 
 
 
228 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1430  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.29 
 
 
236 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3927  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.53 
 
 
228 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 
221 aa  226  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2864  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.29 
 
 
236 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>