More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0850 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
225 aa  453  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  99.11 
 
 
225 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  94.67 
 
 
225 aa  437  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  70.09 
 
 
233 aa  330  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  70.14 
 
 
226 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.57 
 
 
225 aa  320  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3689  ribulose-phosphate 3-epimerase  69.82 
 
 
232 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0005  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  73.97 
 
 
223 aa  315  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591326  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4340  Ribulose-phosphate 3-epimerase  67.56 
 
 
232 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  70.85 
 
 
227 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1771  ribulose-phosphate 3-epimerase  70.23 
 
 
232 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2218  ribulose-phosphate 3-epimerase  68.47 
 
 
233 aa  308  5e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  67.12 
 
 
225 aa  308  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.52 
 
 
225 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  66.82 
 
 
227 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  68.16 
 
 
227 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  66.52 
 
 
243 aa  299  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.86 
 
 
225 aa  294  8e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3710  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  65.47 
 
 
226 aa  294  8e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0845805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1614  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.86 
 
 
231 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.987779  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0991  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.82 
 
 
234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2572  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.02 
 
 
244 aa  286  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.712481  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1430  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.02 
 
 
236 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5332  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  67.14 
 
 
233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137752  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3927  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.82 
 
 
228 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2864  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  66.02 
 
 
236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0856  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.08 
 
 
230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1512  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.29 
 
 
236 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.659208  normal  0.0217297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1198  Ribulose-phosphate 3-epimerase  71.29 
 
 
227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00622607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0827  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.68 
 
 
225 aa  272  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.1 
 
 
219 aa  272  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0932  Ribulose-phosphate 3-epimerase  67.63 
 
 
227 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.01 
 
 
220 aa  271  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.36 
 
 
226 aa  268  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3006  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.2 
 
 
232 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.91 
 
 
221 aa  267  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.37 
 
 
223 aa  264  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3557  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.64 
 
 
228 aa  262  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.01 
 
 
219 aa  256  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 
224 aa  254  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.74 
 
 
224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  59.17 
 
 
225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.47 
 
 
223 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.99 
 
 
236 aa  249  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.5 
 
 
214 aa  247  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.5 
 
 
214 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.5 
 
 
214 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.5 
 
 
214 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.5 
 
 
214 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.5 
 
 
214 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.5 
 
 
214 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.5 
 
 
214 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.5 
 
 
214 aa  246  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.71 
 
 
235 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  60 
 
 
214 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  60 
 
 
214 aa  245  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1322  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.28 
 
 
220 aa  244  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.307834  hitchhiker  0.00000000745159 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.91 
 
 
223 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.42 
 
 
234 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.42 
 
 
234 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.01 
 
 
221 aa  241  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.85 
 
 
218 aa  240  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  54.95 
 
 
224 aa  239  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.93 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 
235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.93 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.3 
 
 
218 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.42 
 
 
234 aa  237  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.76 
 
 
247 aa  236  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.09 
 
 
227 aa  234  7e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.3 
 
 
220 aa  234  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.81 
 
 
230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 
218 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.51 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.86 
 
 
235 aa  232  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.37 
 
 
238 aa  231  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  55 
 
 
224 aa  231  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.12 
 
 
222 aa  231  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.25 
 
 
224 aa  230  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1205  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.55 
 
 
211 aa  230  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.71 
 
 
224 aa  230  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 
232 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 
211 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.13 
 
 
221 aa  229  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1911  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.71 
 
 
230 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.822201  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.3 
 
 
219 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.55 
 
 
220 aa  228  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.55 
 
 
220 aa  228  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 
229 aa  228  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.82 
 
 
224 aa  228  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.11 
 
 
224 aa  228  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 
217 aa  228  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.71 
 
 
228 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.44 
 
 
221 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 
216 aa  227  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.18 
 
 
231 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.09 
 
 
224 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.98 
 
 
224 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.47 
 
 
223 aa  225  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>