More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1327 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.31 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.92 
 
 		 221 aa  246  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 		 218 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55 
 
 		 229 aa  241  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.67 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.38 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 		 225 aa  238  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 		 227 aa  238  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 		 247 aa  238  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.21 
 
 		 234 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.21 
 
 		 234 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.92 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.42 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.29 
 
 		 223 aa  235  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 214 aa  235  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.78 
 
 		 220 aa  235  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 217 aa  235  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 214 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 		 221 aa  234  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 214 aa  234  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 		 224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.29 
 
 		 235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.53 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0449  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.56 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.87 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0446  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.56 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0415  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.56 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.13 
 
 		 222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.5 
 
 		 223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 223 aa  231  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3799  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3494  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.29 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00334689  hitchhiker  0.000085645 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.29 
 
 		 235 aa  231  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.95 
 
 		 225 aa  231  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.99 
 
 		 224 aa  231  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0532  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.36 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.92 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.09 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0827  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.8 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.46 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0167  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.46 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.17 
 
 		 221 aa  228  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3899  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.36 
 
 		 228 aa  228  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.28 
 
 		 221 aa  228  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 		 217 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 224 aa  228  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.07 
 
 		 225 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.92 
 
 		 224 aa  228  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03238  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0327  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3582  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.111758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3763  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0483274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3855  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.83 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3662  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383295  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03190  hypothetical protein  51.39 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4690  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0327  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204958  normal  0.201128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.15 
 
 		 227 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.27 
 
 		 227 aa  228  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 225 aa  228  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.79 
 
 		 227 aa  227  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.95 
 
 		 229 aa  227  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3789  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3682  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.56 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0751  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.61 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0659  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0350  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.82 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.027158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0361  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.82 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.14 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.09 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>