More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1707 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  97.7 
 
 		 217 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.28 
 
 		 211 aa  265  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.34 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0481  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.34 
 
 		 242 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 		 218 aa  245  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.95 
 
 		 232 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.72 
 
 		 224 aa  244  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.29 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.48 
 
 		 214 aa  241  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.4 
 
 		 219 aa  241  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.01 
 
 		 214 aa  241  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.48 
 
 		 214 aa  241  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.46 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.01 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.27 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 230 aa  235  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 		 221 aa  234  7e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.38 
 
 		 225 aa  234  7e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.11 
 
 		 221 aa  234  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.55 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2395  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 221 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.16 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 220 aa  231  6e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.21 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2057  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.31 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.725106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.92 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  50.47 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 		 217 aa  229  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 216 aa  227  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.63 
 
 		 225 aa  226  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.02 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.46 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.16 
 
 		 220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.16 
 
 		 220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 		 223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 		 231 aa  224  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.96 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 216 aa  223  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.49 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.29 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3927  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.92 
 
 		 221 aa  222  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.92 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.05 
 
 		 219 aa  222  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1649  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.82 
 
 		 221 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.16 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.63 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.63 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 		 235 aa  219  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.26 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.42 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.91 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  54 
 
 		 265 aa  218  7e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0827  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.46 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 		 222 aa  217  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 		 217 aa  218  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.43 
 
 		 225 aa  217  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 		 220 aa  217  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.69 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.16 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.63 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.23 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.69 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1167  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 217 aa  215  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000257786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 		 227 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.89 
 
 		 221 aa  215  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2879  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 242 aa  215  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.403873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.89 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1981  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.49 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.564168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2597  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.5 
 
 		 209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.943131  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0746  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0651  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 221 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 		 230 aa  214  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0481  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 		 215 aa  214  7e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 224 aa  214  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.94 
 
 		 223 aa  214  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>