More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0469 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0651  Ribulose-phosphate 3-epimerase  78.28 
 
 		 221 aa  360  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  77.38 
 
 		 221 aa  358  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  73.76 
 
 		 221 aa  349  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  73.76 
 
 		 221 aa  345  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  75.93 
 
 		 218 aa  333  7.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1649  ribulose-phosphate 3-epimerase  72.85 
 
 		 221 aa  330  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.99 
 
 		 224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.52 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.61 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.71 
 
 		 214 aa  238  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.21 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.21 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.21 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.21 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.21 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.21 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.29 
 
 		 219 aa  236  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.21 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.4 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  50.51 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1432  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 220 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.71 
 
 		 214 aa  235  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.71 
 
 		 214 aa  235  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  54.05 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.27 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.72 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0333  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 		 216 aa  231  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.540612  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.13 
 
 		 247 aa  231  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 		 224 aa  231  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  49.77 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.84 
 
 		 232 aa  228  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.8 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.8 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5109  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.72 
 
 		 215 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0277689  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.43 
 
 		 218 aa  224  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.87 
 
 		 216 aa  224  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 221 aa  223  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2292  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.43 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.94 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.77 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 		 224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.15 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.15 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.42 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2874  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.02 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1509  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 		 218 aa  221  8e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.49 
 
 		 220 aa  221  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.43 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.5 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.68 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.26 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.31 
 
 		 235 aa  218  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.51 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.26 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.05 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.04 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.5 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 		 219 aa  215  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2597  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.943131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 		 211 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0049  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.06 
 
 		 222 aa  214  7e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 		 221 aa  214  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.31 
 
 		 235 aa  214  9e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.54 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.47 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.43 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.46 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.74 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.67 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.69 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.76 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2057  ribulose-phosphate 3-epimerase  53 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.725106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.3 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0731  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0365158  normal  0.685056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.9 
 
 		 221 aa  208  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 		 224 aa  208  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 		 225 aa  208  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0991  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.47 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.76 
 
 		 225 aa  208  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 		 223 aa  207  7e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.76 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.26 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 		 222 aa  207  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.5 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.61 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0932  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.47 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.72 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2075  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.99 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.8 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>