More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2051 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  60.75 
 
 		 224 aa  261  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  61.29 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.62 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.26 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.07 
 
 		 236 aa  248  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.59 
 
 		 235 aa  248  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.56 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 		 264 aa  246  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.55 
 
 		 227 aa  244  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.05 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.1 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.1 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.59 
 
 		 235 aa  242  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.26 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.82 
 
 		 227 aa  241  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.9 
 
 		 221 aa  241  9e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2057  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.92 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.725106 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2874  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.79 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.88 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.55 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.34 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  54.63 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 220 aa  236  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.1 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.38 
 
 		 216 aa  234  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2075  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.56 
 
 		 224 aa  234  8e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.09 
 
 		 232 aa  234  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.71 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.88 
 
 		 221 aa  231  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.51 
 
 		 221 aa  231  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.59 
 
 		 222 aa  231  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.82 
 
 		 219 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.37 
 
 		 221 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.37 
 
 		 221 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.27 
 
 		 227 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.81 
 
 		 231 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.25 
 
 		 221 aa  228  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0991  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.01 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.17 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.88 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.49 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.91 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.75 
 
 		 225 aa  225  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.87 
 
 		 217 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.68 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.68 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.68 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0163  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.59 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.68 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.2 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.68 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.68 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0977  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.13 
 
 		 219 aa  225  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213833 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.68 
 
 		 214 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  57 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.79 
 
 		 220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.13 
 
 		 221 aa  224  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.64 
 
 		 221 aa  224  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.38 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.05 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.38 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.96 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.68 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0651  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.73 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.2 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.25 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.88 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.25 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.38 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2292  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.15 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.2 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.16 
 
 		 217 aa  222  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.34 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 		 221 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2756  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.32 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.38 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3121  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.88 
 
 		 241 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.798582  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3720  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.07 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.245172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0005  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2879  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.44 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.403873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1649  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.76 
 
 		 221 aa  218  7e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.97 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.65 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0481  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.91 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.72 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.43 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3689  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.69 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.22 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.12 
 
 		 243 aa  215  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.31 
 
 		 221 aa  215  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.17 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0932  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.86 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 		 227 aa  214  9e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  53 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.22 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2472  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>