More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2292 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2292  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 
220 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.96 
 
 
220 aa  235  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.96 
 
 
220 aa  235  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  54.9 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.22 
 
 
221 aa  228  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.14 
 
 
219 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54 
 
 
224 aa  226  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  54 
 
 
221 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  54 
 
 
221 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.77 
 
 
224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.54 
 
 
221 aa  224  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.73 
 
 
218 aa  224  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.2 
 
 
235 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.54 
 
 
216 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.43 
 
 
221 aa  223  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 
225 aa  222  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.15 
 
 
224 aa  222  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.92 
 
 
225 aa  222  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2057  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.8 
 
 
231 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.725106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.23 
 
 
247 aa  221  9e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 
223 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.42 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 
214 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.45 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.49 
 
 
221 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.15 
 
 
227 aa  219  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 
226 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 
225 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.47 
 
 
219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.43 
 
 
235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.2 
 
 
234 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.2 
 
 
234 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.74 
 
 
214 aa  218  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.24 
 
 
214 aa  218  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.68 
 
 
235 aa  218  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.26 
 
 
221 aa  218  7e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.74 
 
 
214 aa  218  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.24 
 
 
214 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.38 
 
 
225 aa  217  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.46 
 
 
236 aa  218  8.999999999999998e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.9 
 
 
228 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.03 
 
 
225 aa  217  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 
224 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.5 
 
 
222 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.72 
 
 
234 aa  216  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
264 aa  215  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 
222 aa  215  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 
238 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.18 
 
 
233 aa  215  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.26 
 
 
221 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.04 
 
 
219 aa  215  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  49.03 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.73 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1649  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.61 
 
 
221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2597  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.29 
 
 
209 aa  211  5.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.943131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.49 
 
 
243 aa  211  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.01 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.5 
 
 
221 aa  211  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 
227 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 
223 aa  211  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0481  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.37 
 
 
242 aa  210  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1512  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.71 
 
 
236 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.659208  normal  0.0217297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.56 
 
 
218 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
223 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0350  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
226 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.027158  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
223 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.76 
 
 
225 aa  209  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0361  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
226 aa  209  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2572  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 
244 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.712481  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.27 
 
 
227 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.5 
 
 
225 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1430  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.23 
 
 
236 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.26 
 
 
219 aa  209  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0163  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.91 
 
 
241 aa  208  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.468376  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2864  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.23 
 
 
236 aa  208  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.24 
 
 
218 aa  208  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
220 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.52 
 
 
223 aa  208  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3710  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 
226 aa  208  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0845805 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.5 
 
 
228 aa  208  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.76 
 
 
231 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 
232 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0827  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.76 
 
 
225 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1981  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.46 
 
 
236 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.564168  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.26 
 
 
224 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  52 
 
 
225 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  54 
 
 
221 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0651  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.53 
 
 
221 aa  206  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0924  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.51 
 
 
231 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>