More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2597 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2597  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.943131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  53 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.94 
 
 		 211 aa  224  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2395  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 		 221 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.79 
 
 		 222 aa  221  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.78 
 
 		 217 aa  221  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.99 
 
 		 217 aa  216  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.5 
 
 		 217 aa  214  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 221 aa  214  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.24 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0049  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.26 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  50.75 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.02 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2292  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.29 
 
 		 227 aa  211  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 		 219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.5 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.49 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 231 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.5 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.77 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.78 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.24 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0481  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.53 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.26 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.06 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.74 
 
 		 221 aa  207  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.99 
 
 		 221 aa  207  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.5 
 
 		 220 aa  207  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0082  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.53 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.76 
 
 		 235 aa  207  9e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  52 
 
 		 216 aa  207  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 		 221 aa  206  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.99 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.06 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1205  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.94 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.74 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.26 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.53 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3710  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.22 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0845805 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0977  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.27 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.74 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.73 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  51.43 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.29 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.5 
 
 		 222 aa  204  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.89 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  51 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.74 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.74 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.74 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.82 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.49 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.49 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.74 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1509  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.78 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1649  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.48 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.5 
 
 		 224 aa  201  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.54 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.02 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.74 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0731  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.76 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0365158  normal  0.685056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.99 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3927  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.73 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.72 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.03 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.24 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0651  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.21 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2874  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.03 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 		 220 aa  197  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1167  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.04 
 
 		 217 aa  197  7.999999999999999e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000257786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.21 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.72 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0481  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.81 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.28 
 
 		 230 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.67 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>