More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1769 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  81.4 
 
 		 220 aa  365  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.99 
 
 		 216 aa  276  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1509  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.22 
 
 		 218 aa  258  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1167  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.99 
 
 		 217 aa  248  6e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000257786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.68 
 
 		 221 aa  244  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 		 223 aa  241  3.9999999999999997e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.696743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.99 
 
 		 219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.17 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0788  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.06 
 
 		 214 aa  235  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.61 
 
 		 211 aa  231  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.71 
 
 		 221 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.18 
 
 		 222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.95 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 214 aa  221  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1306  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0153242  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1281  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 214 aa  221  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.84 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.91 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 		 214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.45 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.76 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.91 
 
 		 217 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.23 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.76 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3710  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.17 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0845805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.6 
 
 		 229 aa  214  5.9999999999999996e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 		 219 aa  214  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1205  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.72 
 
 		 211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.26 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2597  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.943131  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4448  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.73 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.66 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.08 
 
 		 230 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.47 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.41 
 
 		 223 aa  207  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.93 
 
 		 217 aa  207  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.95 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50761  D-ribulose-5-phosphate 3- epimerase  49.55 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.71 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  46 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  42.01 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.98 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.33 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0856  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.16 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1432  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.49 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.95 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 		 235 aa  204  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 		 219 aa  204  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.74 
 
 		 221 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.5 
 
 		 223 aa  204  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0333  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.01 
 
 		 216 aa  204  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.540612  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 		 225 aa  204  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.86 
 
 		 235 aa  204  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.22 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 		 234 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2572  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.712481  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 		 234 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.72 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1322  ribulose-phosphate 3-epimerase  51 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.307834  hitchhiker  0.00000000745159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 		 226 aa  201  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.17 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.18 
 
 		 218 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.19 
 
 		 247 aa  201  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5109  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 215 aa  201  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0277689  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.72 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.34 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  46.98 
 
 		 265 aa  200  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3006  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.23 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1430  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0377706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>