More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50761 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_50761  D-ribulose-5-phosphate 3- epimerase  100 
 
 
232 aa  473  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07588  ribulose-phosphate 3-epimerase (AFU_orthologue; AFUA_2G15190)  50.62 
 
 
252 aa  241  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337987  normal  0.331774 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41053  predicted protein  53.15 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06630  ribulose-phosphate 3-epimerase, putative  47.96 
 
 
224 aa  231  6e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20015  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.11 
 
 
227 aa  228  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.93 
 
 
224 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.93 
 
 
224 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.93 
 
 
224 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 
220 aa  207  9e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.55 
 
 
219 aa  207  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.81 
 
 
225 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.78 
 
 
234 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.41 
 
 
224 aa  201  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 
218 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.06 
 
 
216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.41 
 
 
219 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.22 
 
 
220 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
211 aa  192  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.05 
 
 
229 aa  192  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17265  predicted protein  45.81 
 
 
204 aa  192  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27529  hitchhiker  0.00915674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.6 
 
 
216 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1205  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.17 
 
 
211 aa  192  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.58 
 
 
216 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.37 
 
 
222 aa  191  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.75 
 
 
232 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 
221 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.89 
 
 
219 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.58 
 
 
220 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.52 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.74 
 
 
231 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.04 
 
 
223 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.54 
 
 
224 aa  188  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.73 
 
 
229 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 
224 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.23 
 
 
228 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.2 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.2 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.2 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.2 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.2 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.2 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.11 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.2 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.18 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.74 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.47 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.24 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.78 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.14 
 
 
229 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.64 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.36 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  39.38 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1865  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.38 
 
 
226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1432  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 
220 aa  181  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.52 
 
 
223 aa  181  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.28 
 
 
214 aa  181  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 
225 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1872  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.44 
 
 
226 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.28 
 
 
214 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.01 
 
 
221 aa  180  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.12 
 
 
220 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.37 
 
 
224 aa  179  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.83 
 
 
231 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.66 
 
 
221 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.48 
 
 
227 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.28 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.92 
 
 
222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.81 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.91 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.99 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.72 
 
 
225 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.99 
 
 
225 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.02 
 
 
220 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1322  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.78 
 
 
220 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.307834  hitchhiker  0.00000000745159 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.91 
 
 
225 aa  178  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.72 
 
 
225 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.45 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.44 
 
 
222 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.13 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.23 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.81 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.35 
 
 
226 aa  178  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.45 
 
 
227 aa  177  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.04 
 
 
221 aa  177  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.74 
 
 
225 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43 
 
 
219 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0856  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.42 
 
 
230 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0271981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.53 
 
 
236 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.92 
 
 
220 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.83 
 
 
240 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
233 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.59 
 
 
221 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0648  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.54 
 
 
234 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.59 
 
 
221 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.37 
 
 
221 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 
218 aa  175  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.2 
 
 
221 aa  175  6e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0743  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.2 
 
 
226 aa  174  7e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000598804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.38 
 
 
224 aa  174  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>