More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1673 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
230 aa  457  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  92.27 
 
 
226 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  72.04 
 
 
220 aa  310  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10820  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  72.9 
 
 
223 aa  308  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00879281  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  69.63 
 
 
220 aa  301  4.0000000000000003e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  69.38 
 
 
240 aa  297  8e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.73 
 
 
241 aa  294  9e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.86 
 
 
231 aa  289  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  72.6 
 
 
221 aa  288  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  64.95 
 
 
218 aa  284  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.86 
 
 
223 aa  272  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2050  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.95 
 
 
221 aa  268  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.81 
 
 
223 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0231785  normal  0.0116458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2446  ribulose-phosphate 3-epimerase  67 
 
 
220 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.56 
 
 
222 aa  261  8.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.85 
 
 
228 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.72 
 
 
222 aa  254  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.28 
 
 
224 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.28 
 
 
224 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.28 
 
 
224 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.93 
 
 
224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 
221 aa  252  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2997  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.79 
 
 
221 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.2 
 
 
225 aa  250  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1370  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.19 
 
 
219 aa  248  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152039  normal  0.078192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 
234 aa  244  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.14 
 
 
229 aa  237  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.38 
 
 
228 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.63 
 
 
232 aa  235  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.56 
 
 
228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.85 
 
 
216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  57 
 
 
222 aa  231  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1865  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
226 aa  230  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1872  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.68 
 
 
226 aa  228  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.25 
 
 
236 aa  218  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2592  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
219 aa  214  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.24 
 
 
229 aa  210  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1721  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.97 
 
 
254 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56384  hitchhiker  0.00217715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 
218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 
220 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 
220 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 
221 aa  191  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0350  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 
226 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.027158  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.16 
 
 
223 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0361  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 
226 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.7 
 
 
223 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.33 
 
 
227 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.59 
 
 
236 aa  188  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.53 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.64 
 
 
225 aa  188  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.7 
 
 
225 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0731  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 
224 aa  187  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0365158  normal  0.685056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.79 
 
 
230 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
221 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
221 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 
225 aa  186  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
214 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 
225 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 
225 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.3 
 
 
227 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.3 
 
 
228 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  40.93 
 
 
217 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.64 
 
 
230 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
214 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
214 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
214 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
214 aa  185  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
214 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
214 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
214 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
224 aa  185  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
214 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.3 
 
 
228 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.3 
 
 
228 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.54 
 
 
225 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.3 
 
 
228 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.79 
 
 
223 aa  185  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.98 
 
 
224 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.74 
 
 
225 aa  185  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.78 
 
 
228 aa  184  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1510  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.3 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000472426  decreased coverage  0.0000666279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.72 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.06 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.79 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.33 
 
 
236 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0381  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.79 
 
 
223 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 
224 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
224 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.62 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3680  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.87 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3851  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.87 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3755  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.87 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.87 
 
 
225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>