More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1865 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1865  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
226 aa  447  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1872  ribulose-phosphate 3-epimerase  94.69 
 
 
226 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2592  ribulose-phosphate 3-epimerase  78.4 
 
 
219 aa  310  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.73 
 
 
225 aa  298  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.28 
 
 
234 aa  291  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.36 
 
 
224 aa  290  9e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.36 
 
 
224 aa  290  9e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.36 
 
 
224 aa  290  9e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.32 
 
 
228 aa  288  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  70.05 
 
 
228 aa  288  7e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.43 
 
 
232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.74 
 
 
216 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.44 
 
 
229 aa  281  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.83 
 
 
224 aa  277  9e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.31 
 
 
222 aa  275  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.45 
 
 
223 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.63 
 
 
231 aa  258  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10820  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.82 
 
 
223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00879281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.89 
 
 
226 aa  245  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.87 
 
 
240 aa  244  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.41 
 
 
220 aa  243  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
230 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2997  ribulose-phosphate 3-epimerase  60 
 
 
221 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 
218 aa  238  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1370  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.47 
 
 
219 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152039  normal  0.078192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.84 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.72 
 
 
222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.93 
 
 
220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.09 
 
 
223 aa  231  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0231785  normal  0.0116458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.96 
 
 
236 aa  231  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.86 
 
 
229 aa  228  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.14 
 
 
221 aa  224  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.09 
 
 
221 aa  223  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2050  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.02 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.63 
 
 
222 aa  219  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2446  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.22 
 
 
220 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1721  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.22 
 
 
254 aa  214  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56384  hitchhiker  0.00217715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 
218 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 
214 aa  198  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.17 
 
 
228 aa  197  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.29 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50761  D-ribulose-5-phosphate 3- epimerase  43.38 
 
 
232 aa  193  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 
218 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 
225 aa  191  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 
226 aa  190  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.98 
 
 
224 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.08 
 
 
217 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 
225 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.37 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.98 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.69 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.27 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 
224 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 
224 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 
224 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.7 
 
 
247 aa  189  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.72 
 
 
221 aa  189  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.89 
 
 
223 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.59 
 
 
218 aa  188  5e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 
224 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 
236 aa  188  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.95 
 
 
227 aa  188  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 
239 aa  188  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.87 
 
 
219 aa  188  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
217 aa  188  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.45 
 
 
235 aa  187  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.6 
 
 
223 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.69 
 
 
225 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.73 
 
 
230 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2879  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.05 
 
 
229 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.22 
 
 
224 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.91 
 
 
219 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.45 
 
 
236 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 
218 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04198  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.91 
 
 
269 aa  185  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2112  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
231 aa  185  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.8 
 
 
264 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
233 aa  184  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4448  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 
230 aa  184  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.45 
 
 
229 aa  184  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.62 
 
 
219 aa  184  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
220 aa  184  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2364  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.78 
 
 
224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.76 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3483  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237875  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.33 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>