More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12790 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0231785  normal  0.0116458 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10820  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.27 
 
 		 223 aa  269  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00879281  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.81 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.36 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  59.72 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  64.25 
 
 		 221 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60 
 
 		 220 aa  257  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.02 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.02 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.02 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.65 
 
 		 220 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.69 
 
 		 241 aa  248  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.77 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2050  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.65 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.13 
 
 		 225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.79 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.35 
 
 		 228 aa  238  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.55 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.72 
 
 		 216 aa  235  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 		 229 aa  235  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.75 
 
 		 223 aa  234  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.76 
 
 		 218 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.15 
 
 		 222 aa  226  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2446  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.47 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.95 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.86 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.87 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454647  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 221 aa  221  6e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1865  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.09 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2997  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.02 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1872  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.17 
 
 		 226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1370  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.72 
 
 		 219 aa  214  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152039  normal  0.078192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2592  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.98 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.22 
 
 		 229 aa  204  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.32 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.12 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.58 
 
 		 221 aa  194  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.54 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.8 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1721  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56384  hitchhiker  0.00217715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.8 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.4 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.8 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 		 214 aa  191  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.66 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.35 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2472  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.41 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2328  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.74 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.377828  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.22 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.6 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2879  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.86 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.87 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.73 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 		 221 aa  187  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 		 221 aa  187  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.75 
 
 		 224 aa  188  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3494  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.28 
 
 		 238 aa  187  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00334689  hitchhiker  0.000085645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.65 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.84 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.38 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03238  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0327  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3662  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383295  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.98 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3855  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004029  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3763  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0483274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3582  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.111758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03190  hypothetical protein  45.07 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0327  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204958  normal  0.201128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.3 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3799  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.38 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4690  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 		 217 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.28 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0167  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.38 
 
 		 236 aa  185  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>