More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2050 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2050  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
221 aa  437  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  70.91 
 
 
220 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  72.27 
 
 
220 aa  325  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  69.41 
 
 
240 aa  314  8e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.13 
 
 
231 aa  298  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.82 
 
 
241 aa  292  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.67 
 
 
223 aa  291  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  63.98 
 
 
226 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  66.06 
 
 
218 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  71.3 
 
 
221 aa  285  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  64.76 
 
 
230 aa  285  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2446  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.49 
 
 
220 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10820  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  66.67 
 
 
223 aa  281  8.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00879281  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  65.89 
 
 
228 aa  267  8.999999999999999e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.12 
 
 
222 aa  265  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2997  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.84 
 
 
221 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 
224 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.56 
 
 
221 aa  259  2e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 
224 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 
224 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 
225 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.65 
 
 
223 aa  258  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0231785  normal  0.0116458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 
234 aa  258  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.88 
 
 
222 aa  254  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1370  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.38 
 
 
219 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152039  normal  0.078192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.59 
 
 
222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.13 
 
 
229 aa  247  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.53 
 
 
232 aa  246  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 
216 aa  244  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.05 
 
 
228 aa  242  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 
224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.13 
 
 
228 aa  239  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.36 
 
 
229 aa  228  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1865  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.02 
 
 
226 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1872  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.56 
 
 
226 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.89 
 
 
236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1721  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.23 
 
 
254 aa  211  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56384  hitchhiker  0.00217715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2592  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.52 
 
 
219 aa  211  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
214 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.31 
 
 
221 aa  204  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
214 aa  204  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.17 
 
 
214 aa  201  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
220 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
221 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.17 
 
 
214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.33 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0731  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.18 
 
 
224 aa  192  4e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0365158  normal  0.685056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 
221 aa  190  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.6 
 
 
221 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.65 
 
 
235 aa  189  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.6 
 
 
221 aa  189  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
221 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.11 
 
 
216 aa  188  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.91 
 
 
238 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.46 
 
 
224 aa  188  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 
224 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
221 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.86 
 
 
235 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.92 
 
 
224 aa  186  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.66 
 
 
247 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.92 
 
 
217 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.09 
 
 
225 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
230 aa  185  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.61 
 
 
217 aa  184  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.26 
 
 
236 aa  184  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
217 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.45 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.76 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.83 
 
 
219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 
220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.72 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.19 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.72 
 
 
223 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50761  D-ribulose-5-phosphate 3- epimerase  41.47 
 
 
232 aa  182  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.59 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.87 
 
 
222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.16 
 
 
219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.54 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
221 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2492  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.4 
 
 
223 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
220 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
220 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
223 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.93 
 
 
225 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0163  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.8 
 
 
241 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.468376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>