More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3728 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  93.27 
 
 
234 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  89.24 
 
 
224 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  89.24 
 
 
224 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  89.24 
 
 
224 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  83.78 
 
 
232 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  75.45 
 
 
228 aa  343  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  79.17 
 
 
229 aa  342  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.95 
 
 
216 aa  329  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.63 
 
 
222 aa  315  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  72.12 
 
 
228 aa  309  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  71.15 
 
 
224 aa  307  9e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.28 
 
 
223 aa  289  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1865  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.73 
 
 
226 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.93 
 
 
231 aa  283  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1872  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.61 
 
 
226 aa  278  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  65.89 
 
 
218 aa  275  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10820  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.04 
 
 
223 aa  275  6e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00879281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2997  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.51 
 
 
221 aa  268  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2592  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.82 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.38 
 
 
236 aa  262  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.48 
 
 
220 aa  261  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.28 
 
 
222 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1721  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.07 
 
 
254 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56384  hitchhiker  0.00217715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.4 
 
 
240 aa  257  9e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  61.29 
 
 
221 aa  254  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1370  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.65 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152039  normal  0.078192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.2 
 
 
230 aa  250  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.7 
 
 
226 aa  249  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.14 
 
 
220 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  64.35 
 
 
229 aa  247  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.13 
 
 
223 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0231785  normal  0.0116458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2050  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 
221 aa  240  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 
241 aa  240  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2446  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.5 
 
 
220 aa  234  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 
222 aa  229  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.87 
 
 
221 aa  227  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.92 
 
 
221 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50761  D-ribulose-5-phosphate 3- epimerase  45.81 
 
 
232 aa  206  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.84 
 
 
221 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 
228 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.6 
 
 
218 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
214 aa  204  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 
214 aa  203  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
224 aa  203  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
214 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
214 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
214 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
214 aa  202  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
214 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
214 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
214 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
214 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
229 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 
221 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 
221 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 
217 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
214 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
219 aa  198  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 
220 aa  198  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.89 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
216 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.19 
 
 
217 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.49 
 
 
227 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.64 
 
 
230 aa  194  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.52 
 
 
218 aa  194  9e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.12 
 
 
224 aa  193  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.78 
 
 
225 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.78 
 
 
225 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.78 
 
 
225 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.89 
 
 
221 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  41.2 
 
 
217 aa  192  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.4 
 
 
221 aa  191  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.89 
 
 
226 aa  191  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.05 
 
 
218 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.12 
 
 
220 aa  191  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.12 
 
 
220 aa  191  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.31 
 
 
224 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.17 
 
 
247 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.76 
 
 
235 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2492  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.85 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0743  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.84 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000598804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.54 
 
 
235 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 
238 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  45 
 
 
223 aa  188  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
235 aa  188  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.01 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 
223 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.03 
 
 
224 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.45 
 
 
223 aa  187  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2879  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.83 
 
 
229 aa  187  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.81 
 
 
228 aa  187  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3483  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.44 
 
 
233 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237875  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.4 
 
 
223 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.37 
 
 
228 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
220 aa  186  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2364  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
229 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.81 
 
 
243 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.2 
 
 
225 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>