More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1725 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 220 aa  435  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  81.36 
 
 		 220 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.31 
 
 		 241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  72.02 
 
 		 240 aa  327  7e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  71.9 
 
 		 226 aa  310  6.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  72.04 
 
 		 230 aa  310  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2050  ribulose-phosphate 3-epimerase  72.27 
 
 		 221 aa  307  8e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  68.54 
 
 		 231 aa  296  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  73.46 
 
 		 221 aa  289  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.67 
 
 		 223 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  67.13 
 
 		 218 aa  284  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10820  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  66.2 
 
 		 223 aa  274  7e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00879281  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 		 222 aa  269  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  65.58 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454647  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.09 
 
 		 221 aa  266  1e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2446  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.01 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.36 
 
 		 222 aa  265  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2997  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.14 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1370  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.98 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152039  normal  0.078192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.14 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.65 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0231785  normal  0.0116458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.61 
 
 		 224 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.61 
 
 		 224 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.61 
 
 		 224 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.38 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 		 234 aa  244  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.69 
 
 		 224 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.62 
 
 		 222 aa  238  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.56 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.84 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.72 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.27 
 
 		 216 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.26 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1872  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.42 
 
 		 226 aa  221  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1865  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.93 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1721  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.68 
 
 		 254 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56384  hitchhiker  0.00217715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.03 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2592  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 		 214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.8 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.76 
 
 		 214 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 		 214 aa  197  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.98 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.83 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 		 218 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.92 
 
 		 214 aa  194  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.06 
 
 		 230 aa  193  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  42.25 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.98 
 
 		 216 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.28 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1510  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.39 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000472426  decreased coverage  0.0000666279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.89 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0350  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.027158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.32 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0361  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.47 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 		 224 aa  188  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.98 
 
 		 219 aa  187  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 		 235 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.46 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.91 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.82 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4601  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.82 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1994  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 		 225 aa  184  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 		 224 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.78 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0731  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.59 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0365158  normal  0.685056 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.13 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>