More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1872 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1872  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1865  ribulose-phosphate 3-epimerase  94.69 
 
 		 226 aa  407  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2592  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.46 
 
 		 219 aa  311  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.61 
 
 		 225 aa  294  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.6 
 
 		 234 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.22 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.22 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.22 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.41 
 
 		 228 aa  286  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  69.08 
 
 		 228 aa  285  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.06 
 
 		 232 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.35 
 
 		 216 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.06 
 
 		 229 aa  278  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.38 
 
 		 224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.9 
 
 		 222 aa  269  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10820  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.26 
 
 		 223 aa  255  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00879281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.08 
 
 		 223 aa  255  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.88 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.06 
 
 		 220 aa  244  6.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.37 
 
 		 226 aa  244  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2997  ribulose-phosphate 3-epimerase  60 
 
 		 221 aa  241  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.68 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.42 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1370  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 		 219 aa  234  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152039  normal  0.078192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.42 
 
 		 220 aa  232  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.14 
 
 		 241 aa  232  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.88 
 
 		 222 aa  228  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.17 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0231785  normal  0.0116458 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.56 
 
 		 221 aa  224  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2050  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.56 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.09 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2446  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.72 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1721  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.72 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56384  hitchhiker  0.00217715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.64 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50761  D-ribulose-5-phosphate 3- epimerase  43.44 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.29 
 
 		 214 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.33 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.27 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.08 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.08 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.51 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.76 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.89 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 		 239 aa  188  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.76 
 
 		 214 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.86 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.66 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3755  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.89 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3851  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3680  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.45 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03238  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0327  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03190  hypothetical protein  47.2 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3582  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.111758  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2112  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3855  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004029  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 		 235 aa  185  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0327  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204958  normal  0.201128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3763  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0483274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3662  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383295  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4690  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.37 
 
 		 221 aa  185  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.95 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.66 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>