More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1370 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1370  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
219 aa  434  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152039  normal  0.078192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  82.65 
 
 
218 aa  354  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  75.93 
 
 
223 aa  335  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  80.82 
 
 
222 aa  328  4e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  71.56 
 
 
231 aa  328  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2997  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.63 
 
 
221 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2446  ribulose-phosphate 3-epimerase  70.81 
 
 
220 aa  299  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10820  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  68.52 
 
 
223 aa  286  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00879281  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  74.07 
 
 
229 aa  279  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.09 
 
 
225 aa  278  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.65 
 
 
234 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.55 
 
 
224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.55 
 
 
224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.55 
 
 
224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.98 
 
 
220 aa  271  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.43 
 
 
236 aa  270  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.48 
 
 
224 aa  270  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  64.19 
 
 
230 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.96 
 
 
220 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  62.79 
 
 
226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.83 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1721  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.17 
 
 
254 aa  268  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56384  hitchhiker  0.00217715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2050  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.38 
 
 
221 aa  265  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.19 
 
 
241 aa  263  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.79 
 
 
216 aa  262  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  69.77 
 
 
221 aa  262  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.37 
 
 
222 aa  260  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.11 
 
 
232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.75 
 
 
228 aa  254  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.44 
 
 
228 aa  254  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.4 
 
 
229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1865  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.47 
 
 
226 aa  248  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1872  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 
226 aa  245  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.72 
 
 
223 aa  236  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0231785  normal  0.0116458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.05 
 
 
214 aa  234  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
214 aa  232  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 
228 aa  231  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454647  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.84 
 
 
222 aa  231  6e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
214 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2592  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.22 
 
 
219 aa  228  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.16 
 
 
221 aa  228  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.16 
 
 
221 aa  228  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 
221 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.88 
 
 
221 aa  227  9e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.09 
 
 
221 aa  227  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.02 
 
 
221 aa  224  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 
218 aa  224  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.3 
 
 
216 aa  224  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.87 
 
 
219 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.14 
 
 
221 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.42 
 
 
224 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.54 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.09 
 
 
221 aa  218  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.21 
 
 
220 aa  218  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 
229 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
219 aa  215  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.11 
 
 
230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.56 
 
 
221 aa  215  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.72 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
224 aa  210  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.82 
 
 
230 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.97 
 
 
224 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.97 
 
 
224 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.32 
 
 
219 aa  209  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.94 
 
 
225 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.94 
 
 
225 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07910  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.94 
 
 
224 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.94 
 
 
225 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.89 
 
 
217 aa  208  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.17 
 
 
224 aa  208  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 
224 aa  207  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
223 aa  207  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
228 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 
221 aa  207  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
228 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.39 
 
 
219 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.71 
 
 
224 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2364  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 
229 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0751  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 
224 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
224 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.52 
 
 
223 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.68 
 
 
239 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1510  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.13 
 
 
232 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000472426  decreased coverage  0.0000666279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.54 
 
 
228 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 
217 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.45 
 
 
225 aa  205  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.71 
 
 
230 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 
217 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.54 
 
 
228 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.54 
 
 
228 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.42 
 
 
223 aa  204  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>