More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3593 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  84.62 
 
 		 221 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  81 
 
 		 221 aa  361  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  81.9 
 
 		 221 aa  361  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  81 
 
 		 221 aa  359  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  78.28 
 
 		 221 aa  348  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.78 
 
 		 221 aa  348  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.92 
 
 		 220 aa  298  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  67.92 
 
 		 220 aa  298  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.81 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.3 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.07 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.07 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.07 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.07 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.07 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.07 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.07 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.07 
 
 		 214 aa  285  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.59 
 
 		 214 aa  285  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.38 
 
 		 214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.07 
 
 		 214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.19 
 
 		 227 aa  279  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.47 
 
 		 224 aa  278  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.41 
 
 		 224 aa  276  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.19 
 
 		 235 aa  276  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 		 234 aa  275  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 		 234 aa  275  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.19 
 
 		 235 aa  274  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 		 230 aa  272  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.5 
 
 		 221 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.19 
 
 		 236 aa  272  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 221 aa  271  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 		 222 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.55 
 
 		 219 aa  267  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.5 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.72 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 216 aa  265  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  60.55 
 
 		 265 aa  265  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.48 
 
 		 218 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 		 224 aa  264  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 		 224 aa  264  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.26 
 
 		 219 aa  264  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 		 243 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.67 
 
 		 227 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.69 
 
 		 224 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.17 
 
 		 225 aa  258  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.17 
 
 		 225 aa  258  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.17 
 
 		 225 aa  258  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 		 236 aa  258  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 		 224 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 		 224 aa  258  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0267  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 		 222 aa  258  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.137082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 		 228 aa  258  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.22 
 
 		 224 aa  257  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.22 
 
 		 224 aa  257  9e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.22 
 
 		 224 aa  257  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.24 
 
 		 225 aa  256  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.24 
 
 		 225 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.62 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.52 
 
 		 225 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0381  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.22 
 
 		 223 aa  255  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.24 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.69 
 
 		 225 aa  255  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4601  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.8 
 
 		 225 aa  254  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 		 230 aa  254  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.5 
 
 		 234 aa  254  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.69 
 
 		 225 aa  254  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03238  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0327  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4690  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03190  hypothetical protein  57.75 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0327  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204958  normal  0.201128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3680  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3582  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.111758  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3851  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3755  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3855  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004029  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3763  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0483274  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.77 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.01 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3662  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383295  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2786  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.53 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.84 
 
 		 224 aa  252  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.28 
 
 		 227 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.29 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.92 
 
 		 223 aa  251  5.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.02 
 
 		 232 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3176  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.56 
 
 		 266 aa  251  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>