More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1857 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.31 
 
 		 220 aa  335  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  71.7 
 
 		 220 aa  320  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  68.69 
 
 		 240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  66.19 
 
 		 226 aa  295  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  65.73 
 
 		 230 aa  294  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.21 
 
 		 231 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.08 
 
 		 222 aa  279  4e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.62 
 
 		 221 aa  278  4e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10820  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  68.81 
 
 		 223 aa  275  5e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00879281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  64.95 
 
 		 218 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2050  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.82 
 
 		 221 aa  275  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.08 
 
 		 223 aa  267  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  67.14 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.47 
 
 		 222 aa  252  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2446  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.68 
 
 		 220 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2997  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.97 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.69 
 
 		 223 aa  248  6e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0231785  normal  0.0116458 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1370  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.19 
 
 		 219 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152039  normal  0.078192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 		 224 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 		 224 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 		 224 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.68 
 
 		 224 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.88 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 		 234 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.2 
 
 		 222 aa  234  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.72 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.05 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.25 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.25 
 
 		 228 aa  228  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1865  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.84 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1872  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.14 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.41 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.17 
 
 		 223 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 221 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 223 aa  205  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1721  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.71 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56384  hitchhiker  0.00217715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2592  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.56 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.31 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.3 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.3 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07910  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0751  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.9 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.83 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0415  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.31 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.53 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.6 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.87 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0446  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.53 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0449  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.53 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.31 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.53 
 
 		 224 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.17 
 
 		 221 aa  195  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 220 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 		 220 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.47 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 		 230 aa  194  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.64 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2472  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.16 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.01 
 
 		 236 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.3 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3851  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3680  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3755  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.73 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1715  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.24 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1994  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.18 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.73 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>