More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_10820 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_10820  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
223 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00879281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  73.36 
 
 
226 aa  314  7e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  72.9 
 
 
230 aa  308  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  72.17 
 
 
231 aa  306  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  70.97 
 
 
223 aa  296  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  71.63 
 
 
218 aa  290  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.51 
 
 
240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  66.2 
 
 
220 aa  284  8e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  70 
 
 
221 aa  277  9e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  68.81 
 
 
241 aa  275  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.04 
 
 
225 aa  275  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.2 
 
 
220 aa  274  8e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.47 
 
 
234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 
224 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 
224 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2446  ribulose-phosphate 3-epimerase  69.31 
 
 
220 aa  271  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 
224 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.27 
 
 
223 aa  269  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0231785  normal  0.0116458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.26 
 
 
216 aa  267  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2050  ribulose-phosphate 3-epimerase  69.27 
 
 
221 aa  266  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  68.98 
 
 
222 aa  263  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1370  ribulose-phosphate 3-epimerase  68.52 
 
 
219 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152039  normal  0.078192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2997  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.61 
 
 
221 aa  261  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.33 
 
 
224 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 
232 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.33 
 
 
228 aa  257  9e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  64.32 
 
 
228 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.13 
 
 
222 aa  254  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.19 
 
 
229 aa  255  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.99 
 
 
228 aa  249  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 
222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1872  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.26 
 
 
226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.06 
 
 
221 aa  241  9e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1865  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.82 
 
 
226 aa  239  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1721  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.19 
 
 
254 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56384  hitchhiker  0.00217715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.45 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2592  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.32 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.96 
 
 
229 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 
221 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
218 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.87 
 
 
221 aa  201  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.6 
 
 
221 aa  201  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.6 
 
 
221 aa  201  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 
214 aa  197  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 
229 aa  197  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
214 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.62 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
214 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 
221 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.18 
 
 
221 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2492  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.7 
 
 
223 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.87 
 
 
221 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.05 
 
 
236 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.34 
 
 
224 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2582  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.49 
 
 
230 aa  191  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.18 
 
 
224 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.69 
 
 
225 aa  191  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.86 
 
 
216 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.23 
 
 
217 aa  190  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0494  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.84 
 
 
232 aa  190  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.59 
 
 
220 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.59 
 
 
224 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2879  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 
229 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.73 
 
 
224 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.43 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1981  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.67 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.564168  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.25 
 
 
225 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.25 
 
 
225 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.25 
 
 
225 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2472  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 
232 aa  187  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.36 
 
 
224 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0361  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.89 
 
 
226 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0350  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.89 
 
 
226 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.027158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04198  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 
269 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3899  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.61 
 
 
228 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.61 
 
 
225 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
220 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 
225 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1715  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
229 aa  186  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
220 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.98 
 
 
227 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.61 
 
 
225 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.8 
 
 
227 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.01 
 
 
223 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.25 
 
 
224 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.61 
 
 
225 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.09 
 
 
232 aa  185  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.61 
 
 
236 aa  185  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1994  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
229 aa  185  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>