More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0722 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0350  ribulose-phosphate 3-epimerase  88.94 
 
 		 226 aa  411  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.027158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0361  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  88.94 
 
 		 226 aa  411  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0532  ribulose-phosphate 3-epimerase  82.43 
 
 		 238 aa  377  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0438  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  84.44 
 
 		 226 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440703 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3660  ribulose-phosphate 3-epimerase  84.75 
 
 		 230 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3899  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.68 
 
 		 228 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  83.56 
 
 		 231 aa  363  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0494  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.53 
 
 		 232 aa  355  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  76.42 
 
 		 229 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3756  ribulose-phosphate 3-epimerase  75.57 
 
 		 225 aa  354  7.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0587  ribulose-phosphate 3-epimerase  79.11 
 
 		 226 aa  344  8e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1510  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  74.89 
 
 		 232 aa  343  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000472426  decreased coverage  0.0000666279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.11 
 
 		 228 aa  309  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.96 
 
 		 228 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.52 
 
 		 228 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.52 
 
 		 227 aa  308  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.81 
 
 		 228 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.81 
 
 		 228 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.81 
 
 		 228 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.81 
 
 		 224 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.52 
 
 		 243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  66.22 
 
 		 230 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.2 
 
 		 224 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.49 
 
 		 224 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.96 
 
 		 228 aa  303  1.0000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.67 
 
 		 236 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3121  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.35 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.798582  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.37 
 
 		 224 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3494  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.49 
 
 		 238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00334689  hitchhiker  0.000085645 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1994  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.78 
 
 		 229 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.7 
 
 		 230 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1715  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  65.78 
 
 		 229 aa  301  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2756  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.91 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.04 
 
 		 227 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.22 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.22 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.22 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2879  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.19 
 
 		 242 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.403873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.93 
 
 		 224 aa  299  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4601  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.22 
 
 		 225 aa  298  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.38 
 
 		 233 aa  297  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  66.37 
 
 		 225 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.81 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.96 
 
 		 220 aa  295  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  63.96 
 
 		 220 aa  295  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.37 
 
 		 225 aa  295  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3581  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.93 
 
 		 228 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3554  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.93 
 
 		 228 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.37 
 
 		 224 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0642  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.93 
 
 		 231 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0535  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.93 
 
 		 231 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.353597  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3573  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.64 
 
 		 243 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0938  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.93 
 
 		 231 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1908  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.93 
 
 		 231 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2879  Ribulose-phosphate 3-epimerase  65.04 
 
 		 229 aa  294  7e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  65.93 
 
 		 225 aa  294  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.93 
 
 		 224 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0167  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.51 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3176  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.95 
 
 		 266 aa  293  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0659  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.04 
 
 		 228 aa  293  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  65.93 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  65.93 
 
 		 224 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0163  Ribulose-phosphate 3-epimerase  64.44 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.93 
 
 		 224 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2364  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.72 
 
 		 229 aa  292  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.47 
 
 		 223 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0449  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.6 
 
 		 224 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0446  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.6 
 
 		 224 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.41 
 
 		 225 aa  292  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.16 
 
 		 224 aa  291  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0415  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.6 
 
 		 255 aa  291  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2492  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.68 
 
 		 223 aa  291  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0751  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.16 
 
 		 224 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00503  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.32 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07910  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.72 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.47 
 
 		 224 aa  289  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.6 
 
 		 224 aa  288  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.56 
 
 		 225 aa  288  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2112  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.32 
 
 		 231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.51 
 
 		 236 aa  288  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.32 
 
 		 224 aa  287  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3755  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.96 
 
 		 225 aa  287  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.32 
 
 		 224 aa  287  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2569  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.08 
 
 		 228 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0536  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.08 
 
 		 228 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3851  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.96 
 
 		 225 aa  287  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3680  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.96 
 
 		 225 aa  287  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.83 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.06 
 
 		 223 aa  286  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0267  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.16 
 
 		 222 aa  287  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.137082  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.51 
 
 		 223 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.83 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3682  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.51 
 
 		 225 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.8 
 
 		 223 aa  285  5e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2328  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.48 
 
 		 228 aa  284  5.999999999999999e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.377828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3789  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.51 
 
 		 225 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.25 
 
 		 223 aa  284  8e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2582  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.84 
 
 		 230 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04198  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.44 
 
 		 269 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>