More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1276 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
229 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.73 
 
 
223 aa  298  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.9 
 
 
231 aa  297  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1370  ribulose-phosphate 3-epimerase  74.07 
 
 
219 aa  293  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152039  normal  0.078192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.2 
 
 
224 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.2 
 
 
224 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.2 
 
 
224 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  69.41 
 
 
218 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.28 
 
 
225 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  72.22 
 
 
222 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.74 
 
 
234 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.28 
 
 
216 aa  284  9e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1721  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.49 
 
 
254 aa  280  9e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56384  hitchhiker  0.00217715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2997  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.12 
 
 
221 aa  278  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  64.98 
 
 
236 aa  278  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.34 
 
 
222 aa  270  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.84 
 
 
232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2446  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.16 
 
 
220 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.02 
 
 
224 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.64 
 
 
229 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.41 
 
 
228 aa  262  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.17 
 
 
220 aa  262  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10820  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.89 
 
 
223 aa  262  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00879281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.65 
 
 
228 aa  257  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1872  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 
226 aa  255  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.17 
 
 
220 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1865  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.86 
 
 
226 aa  254  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2592  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.39 
 
 
219 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.91 
 
 
240 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2050  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.93 
 
 
221 aa  248  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  63.06 
 
 
221 aa  248  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 
226 aa  244  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 
241 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.19 
 
 
230 aa  239  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.25 
 
 
221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
223 aa  236  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0231785  normal  0.0116458 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.13 
 
 
222 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
221 aa  221  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.28 
 
 
216 aa  218  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.06 
 
 
214 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
214 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.88 
 
 
228 aa  214  7e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.7 
 
 
219 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.73 
 
 
224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 
221 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.1 
 
 
230 aa  210  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.83 
 
 
229 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50761  D-ribulose-5-phosphate 3- epimerase  45.16 
 
 
232 aa  206  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.32 
 
 
220 aa  205  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.71 
 
 
224 aa  203  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.53 
 
 
217 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.16 
 
 
218 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.87 
 
 
239 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
221 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
221 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.73 
 
 
225 aa  202  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.73 
 
 
225 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.73 
 
 
225 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.79 
 
 
228 aa  201  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.79 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.22 
 
 
231 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 
219 aa  198  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
223 aa  197  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.6 
 
 
221 aa  197  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.58 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1510  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000472426  decreased coverage  0.0000666279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.13 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2879  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 
229 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2492  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
223 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.16 
 
 
236 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.24 
 
 
219 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
247 aa  195  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.77 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.6 
 
 
227 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.95 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 
224 aa  194  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3899  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
228 aa  194  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312657 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 
223 aa  194  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 
225 aa  194  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.42 
 
 
226 aa  194  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 
223 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
224 aa  194  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.12 
 
 
235 aa  194  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3483  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.42 
 
 
233 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237875  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0924  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.74 
 
 
231 aa  193  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3756  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.64 
 
 
225 aa  193  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>