More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0074 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 224 aa  453  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 216 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 		 221 aa  241  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.56 
 
 		 218 aa  238  8e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.44 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 		 223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.16 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.33 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2364  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.29 
 
 		 229 aa  231  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3680  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0342  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.93 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3755  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2328  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.81 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.377828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3851  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.18 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2879  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.83 
 
 		 229 aa  228  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.43 
 
 		 214 aa  228  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.48 
 
 		 228 aa  228  7e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3789  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.95 
 
 		 225 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.11 
 
 		 228 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.95 
 
 		 224 aa  228  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 		 221 aa  227  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3682  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.95 
 
 		 225 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03238  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0327  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4690  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3855  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.62 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0327  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204958  normal  0.201128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3763  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0483274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4601  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.47 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3582  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.111758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03190  hypothetical protein  54.46 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.95 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07910  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.24 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3662  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383295  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.43 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.62 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.95 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.94 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.62 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.62 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.95 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0167  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0751  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.76 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.41 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.59 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.95 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.97 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.14 
 
 		 227 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.94 
 
 		 221 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2582  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.37 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.61 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.96 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.96 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2230  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.21 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.375841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3799  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.47 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.96 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0924  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.8 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2492  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.27 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0746  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1363  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.56 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00503  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.91 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1981  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.34 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.564168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.15 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.15 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.61 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0267  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 		 222 aa  221  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.137082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.38 
 
 		 220 aa  221  9e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2879  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.54 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.403873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3483  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.61 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237875  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.66 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>