More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0447 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  85.07 
 
 
224 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  83.93 
 
 
224 aa  362  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  83.93 
 
 
224 aa  362  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 
221 aa  277  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 
221 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.33 
 
 
236 aa  276  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.79 
 
 
235 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.33 
 
 
235 aa  275  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 
220 aa  274  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.86 
 
 
247 aa  274  9e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.86 
 
 
234 aa  271  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.86 
 
 
234 aa  271  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.26 
 
 
238 aa  271  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.45 
 
 
221 aa  271  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.4 
 
 
235 aa  271  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 
214 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 
214 aa  270  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 
214 aa  270  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 
214 aa  270  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 
214 aa  270  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 
214 aa  270  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 
214 aa  270  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 
214 aa  270  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 
221 aa  270  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 
214 aa  270  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.49 
 
 
214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.99 
 
 
227 aa  268  4e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 
214 aa  268  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  63.51 
 
 
221 aa  268  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.03 
 
 
221 aa  268  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.61 
 
 
221 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.19 
 
 
221 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.09 
 
 
221 aa  262  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.52 
 
 
264 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
221 aa  258  6e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 
218 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.74 
 
 
221 aa  255  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.19 
 
 
219 aa  255  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.52 
 
 
229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.97 
 
 
224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  55.71 
 
 
224 aa  251  6e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.76 
 
 
218 aa  250  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  57.67 
 
 
265 aa  250  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.42 
 
 
224 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.7 
 
 
231 aa  244  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 
227 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.16 
 
 
222 aa  244  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.5 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.16 
 
 
233 aa  241  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.71 
 
 
226 aa  241  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  53 
 
 
224 aa  241  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.56 
 
 
227 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.5 
 
 
222 aa  239  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 
224 aa  239  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.88 
 
 
220 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.83 
 
 
220 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.83 
 
 
220 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.14 
 
 
219 aa  238  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 
219 aa  238  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.48 
 
 
221 aa  238  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.15 
 
 
216 aa  237  9e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 
232 aa  237  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.91 
 
 
225 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.02 
 
 
225 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.88 
 
 
225 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2075  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.72 
 
 
224 aa  235  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.78 
 
 
243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.81 
 
 
230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.34 
 
 
228 aa  234  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.22 
 
 
219 aa  234  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.81 
 
 
225 aa  234  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 
225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.15 
 
 
224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.43 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.34 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.57 
 
 
229 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 
223 aa  232  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 
211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.11 
 
 
224 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.43 
 
 
225 aa  230  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.99 
 
 
230 aa  230  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.93 
 
 
225 aa  230  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.22 
 
 
236 aa  230  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.22 
 
 
224 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.66 
 
 
224 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.56 
 
 
225 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.67 
 
 
227 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.78 
 
 
224 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.55 
 
 
230 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  53 
 
 
228 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.03 
 
 
220 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  53 
 
 
228 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 
224 aa  228  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.67 
 
 
239 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.27 
 
 
228 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07910  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.69 
 
 
224 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.27 
 
 
228 aa  228  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0751  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.69 
 
 
224 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>