More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1996 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  88.55 
 
 		 235 aa  414  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  88.11 
 
 		 235 aa  415  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  87.17 
 
 		 234 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  87.17 
 
 		 234 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  85.84 
 
 		 247 aa  395  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  82.67 
 
 		 236 aa  394  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  82.82 
 
 		 235 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.78 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  75.77 
 
 		 227 aa  358  3e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  76.02 
 
 		 221 aa  353  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  75.57 
 
 		 221 aa  351  5.9999999999999994e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  71.04 
 
 		 265 aa  340  9e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.81 
 
 		 221 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.81 
 
 		 221 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.95 
 
 		 221 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  66.2 
 
 		 221 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.68 
 
 		 224 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.62 
 
 		 214 aa  274  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.62 
 
 		 214 aa  274  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.62 
 
 		 214 aa  274  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.62 
 
 		 214 aa  274  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.62 
 
 		 214 aa  274  9e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.62 
 
 		 214 aa  274  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.62 
 
 		 214 aa  274  9e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.62 
 
 		 214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.14 
 
 		 221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.62 
 
 		 214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.62 
 
 		 214 aa  272  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.15 
 
 		 214 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  64.22 
 
 		 221 aa  270  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.76 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.01 
 
 		 220 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  64.62 
 
 		 224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  64.62 
 
 		 224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.68 
 
 		 230 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.21 
 
 		 218 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.21 
 
 		 221 aa  267  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.89 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 		 220 aa  264  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 		 220 aa  264  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.54 
 
 		 234 aa  262  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 218 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.41 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.84 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.75 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  59 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.68 
 
 		 220 aa  246  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.05 
 
 		 224 aa  244  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.43 
 
 		 233 aa  244  8e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.55 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.67 
 
 		 216 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.6 
 
 		 222 aa  241  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.59 
 
 		 225 aa  241  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.59 
 
 		 225 aa  241  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.59 
 
 		 225 aa  241  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.02 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.02 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.34 
 
 		 222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.68 
 
 		 219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 		 219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.09 
 
 		 224 aa  238  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.5 
 
 		 219 aa  238  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2786  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 		 234 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 		 231 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.67 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.07 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.56 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.56 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.75 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3899  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.13 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.13 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3689  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.83 
 
 		 232 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.09 
 
 		 228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 		 227 aa  235  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.09 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3176  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.73 
 
 		 266 aa  234  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.21 
 
 		 225 aa  234  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.09 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.67 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.74 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1771  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.41 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.617739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03238  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0327  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.51 
 
 		 223 aa  232  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3662  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383295  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3763  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0483274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03190  hypothetical protein  51.74 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4690  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3855  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.07 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3582  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.111758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0327  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204958  normal  0.201128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>