More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1230 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  90.87 
 
 		 227 aa  414  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  87.78 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  86.7 
 
 		 221 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  81 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  78.83 
 
 		 234 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  78.83 
 
 		 234 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.03 
 
 		 235 aa  357  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.48 
 
 		 235 aa  355  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.03 
 
 		 235 aa  355  2.9999999999999997e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.27 
 
 		 236 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  75.57 
 
 		 238 aa  351  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  71.23 
 
 		 265 aa  330  8e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 221 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 221 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.43 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.43 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.43 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.43 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.43 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.43 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.43 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.43 
 
 		 214 aa  269  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.9 
 
 		 214 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 		 220 aa  268  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 224 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.95 
 
 		 214 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.48 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  66.5 
 
 		 221 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.38 
 
 		 220 aa  263  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  60.38 
 
 		 220 aa  263  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.43 
 
 		 221 aa  262  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.1 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.21 
 
 		 221 aa  258  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  60.85 
 
 		 224 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  60.85 
 
 		 224 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.25 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.75 
 
 		 221 aa  254  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.6 
 
 		 218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.75 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.22 
 
 		 219 aa  251  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.54 
 
 		 234 aa  251  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.75 
 
 		 223 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.6 
 
 		 222 aa  247  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.71 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.41 
 
 		 221 aa  245  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 		 220 aa  244  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  53.33 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.42 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.58 
 
 		 223 aa  242  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.88 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.9 
 
 		 224 aa  241  9e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.6 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.32 
 
 		 221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 		 224 aa  238  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.22 
 
 		 219 aa  238  5e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.09 
 
 		 227 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.67 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.83 
 
 		 216 aa  235  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 		 217 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.87 
 
 		 231 aa  234  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 243 aa  234  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.61 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 		 228 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.11 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0163  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.78 
 
 		 241 aa  231  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 		 219 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 228 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.15 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.45 
 
 		 221 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2786  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.13 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2218  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.8 
 
 		 227 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3573  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 		 243 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0642  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0535  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.353597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3554  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0938  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3581  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1908  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 228 aa  228  7e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.49 
 
 		 230 aa  227  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.33 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5332  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137752  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.08 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3494  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 		 238 aa  225  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00334689  hitchhiker  0.000085645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3689  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.15 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.16 
 
 		 236 aa  225  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>