More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1537 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.47 
 
 		 220 aa  291  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.97 
 
 		 221 aa  276  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.5 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 		 221 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 		 221 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.03 
 
 		 214 aa  268  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.74 
 
 		 216 aa  268  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.14 
 
 		 224 aa  263  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.62 
 
 		 214 aa  261  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.11 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.34 
 
 		 219 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.61 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.72 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.61 
 
 		 235 aa  251  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 		 236 aa  251  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.8 
 
 		 221 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.17 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.6 
 
 		 219 aa  248  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.87 
 
 		 224 aa  248  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.69 
 
 		 221 aa  248  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 		 217 aa  248  7e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.67 
 
 		 218 aa  247  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.6 
 
 		 221 aa  247  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.94 
 
 		 235 aa  247  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.48 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.34 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.67 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.5 
 
 		 223 aa  244  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 		 224 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.25 
 
 		 220 aa  244  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.25 
 
 		 220 aa  244  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.05 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.67 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.6 
 
 		 231 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.71 
 
 		 264 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.6 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.98 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.4 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.5 
 
 		 227 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.22 
 
 		 234 aa  238  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.99 
 
 		 217 aa  237  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.16 
 
 		 232 aa  236  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.77 
 
 		 227 aa  235  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.5 
 
 		 225 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0856  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.98 
 
 		 230 aa  234  7e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0271981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  53.7 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.42 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.05 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.83 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.13 
 
 		 217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  55 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.59 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.87 
 
 		 219 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1994  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.18 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1715  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.99 
 
 		 223 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  50.24 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.05 
 
 		 227 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.17 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.9 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.24 
 
 		 225 aa  228  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.13 
 
 		 221 aa  228  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.24 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.09 
 
 		 219 aa  228  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.68 
 
 		 243 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5332  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.45 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137752  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.38 
 
 		 224 aa  226  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0082  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.18 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.47 
 
 		 225 aa  225  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1510  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.32 
 
 		 232 aa  225  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000472426  decreased coverage  0.0000666279 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0005  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.5 
 
 		 223 aa  225  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591326  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.29 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.71 
 
 		 223 aa  224  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.18 
 
 		 219 aa  225  5.0000000000000005e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.05 
 
 		 215 aa  224  8e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>