More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0856 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0856  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
230 aa  464  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.45 
 
 
226 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.65 
 
 
225 aa  302  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.15 
 
 
225 aa  297  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.77 
 
 
225 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.77 
 
 
225 aa  295  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.36 
 
 
227 aa  295  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.91 
 
 
227 aa  294  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 
233 aa  290  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  60.93 
 
 
227 aa  288  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  62.15 
 
 
225 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.62 
 
 
225 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4340  Ribulose-phosphate 3-epimerase  63.55 
 
 
232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0005  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.44 
 
 
223 aa  281  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591326  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3689  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.75 
 
 
232 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1771  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.5 
 
 
232 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0991  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.4 
 
 
234 aa  272  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3557  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.37 
 
 
228 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5332  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.9 
 
 
233 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137752  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2218  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 
233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3927  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.09 
 
 
228 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.33 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.96 
 
 
243 aa  265  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0932  Ribulose-phosphate 3-epimerase  62.02 
 
 
227 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.47 
 
 
223 aa  261  6.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1614  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.83 
 
 
231 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.987779  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3710  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.76 
 
 
226 aa  258  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0845805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0827  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.5 
 
 
225 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.56 
 
 
221 aa  256  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 
220 aa  255  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2572  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.79 
 
 
244 aa  254  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.712481  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.48 
 
 
225 aa  254  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1430  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.21 
 
 
236 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.55 
 
 
219 aa  252  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2864  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.21 
 
 
236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.79 
 
 
226 aa  251  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 
218 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.98 
 
 
222 aa  248  6e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.3 
 
 
225 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.74 
 
 
223 aa  246  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3006  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.79 
 
 
232 aa  246  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 
224 aa  245  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.09 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.94 
 
 
214 aa  242  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.56 
 
 
221 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1198  Ribulose-phosphate 3-epimerase  60.3 
 
 
227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00622607 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.45 
 
 
214 aa  241  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.13 
 
 
236 aa  241  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1911  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.48 
 
 
230 aa  239  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.822201  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.53 
 
 
218 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 
227 aa  238  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.47 
 
 
221 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1322  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 
220 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.307834  hitchhiker  0.00000000745159 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 
214 aa  237  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.21 
 
 
247 aa  236  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  54.95 
 
 
224 aa  235  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.75 
 
 
235 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 
221 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1512  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.92 
 
 
236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.659208  normal  0.0217297 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.95 
 
 
220 aa  234  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.95 
 
 
220 aa  234  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.51 
 
 
229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 
220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.75 
 
 
235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.02 
 
 
223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.84 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.17 
 
 
224 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2756  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.57 
 
 
241 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.75 
 
 
234 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.75 
 
 
234 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3121  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.57 
 
 
241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.798582  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.29 
 
 
233 aa  231  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3176  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.29 
 
 
266 aa  231  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 
224 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 
221 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.94 
 
 
236 aa  231  7.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.78 
 
 
221 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.95 
 
 
224 aa  231  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.56 
 
 
225 aa  230  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.66 
 
 
228 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.69 
 
 
217 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.42 
 
 
225 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.05 
 
 
227 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3756  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.97 
 
 
225 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.02 
 
 
224 aa  228  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.38 
 
 
235 aa  228  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.42 
 
 
225 aa  228  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.42 
 
 
225 aa  228  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.14 
 
 
228 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.14 
 
 
228 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.14 
 
 
228 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
224 aa  227  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>