More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0743 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0743  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
226 aa  457  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000598804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.29 
 
 
224 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
214 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
214 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 
218 aa  202  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
214 aa  201  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4448  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
214 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
214 aa  198  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.98 
 
 
232 aa  197  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
218 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.33 
 
 
221 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0833  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.74 
 
 
227 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.24 
 
 
227 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.81 
 
 
220 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
225 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
225 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.21 
 
 
227 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
221 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
218 aa  191  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 
235 aa  190  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.09 
 
 
235 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2074  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.04 
 
 
222 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000380872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.22 
 
 
220 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0103  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.04 
 
 
231 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0118359  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.49 
 
 
225 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2564  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.5 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.84 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.08 
 
 
264 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.8 
 
 
223 aa  188  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
227 aa  187  8e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.56 
 
 
234 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.56 
 
 
234 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.22 
 
 
223 aa  187  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
224 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.55 
 
 
225 aa  187  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 
219 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
224 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.13 
 
 
236 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
224 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.33 
 
 
234 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.56 
 
 
238 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.73 
 
 
221 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  43.87 
 
 
217 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
219 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.33 
 
 
216 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 
223 aa  185  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.41 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.08 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.66 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.4 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0481  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.18 
 
 
215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.6 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0476  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.29 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3605  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.52 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406729  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.67 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  44.29 
 
 
224 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.71 
 
 
236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0991  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 
234 aa  181  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 
232 aa  181  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
230 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3557  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 
228 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0501  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.81 
 
 
215 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.33 
 
 
216 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.38 
 
 
224 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.9 
 
 
228 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0932  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 
227 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.33 
 
 
221 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.33 
 
 
221 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.6 
 
 
225 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.66 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.43 
 
 
222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.33 
 
 
221 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
223 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1664  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.38 
 
 
232 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00014027  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2572  ribulose-phosphate 3-epimerase  44 
 
 
244 aa  178  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.712481  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.38 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.78 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 
225 aa  178  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 
228 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.48 
 
 
219 aa  177  8e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
215 aa  177  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0669  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.97 
 
 
225 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000493752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.48 
 
 
223 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1432  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.78 
 
 
220 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
221 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.05 
 
 
222 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.5 
 
 
216 aa  177  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.72 
 
 
217 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>