More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1664 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1664  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
232 aa  463  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00014027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 
217 aa  222  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 
218 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 
216 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 
235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.17 
 
 
236 aa  209  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1167  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.26 
 
 
217 aa  208  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000257786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.48 
 
 
221 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.95 
 
 
247 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.37 
 
 
224 aa  206  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.1 
 
 
223 aa  206  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.696743  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1509  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.84 
 
 
218 aa  206  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 
234 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 
221 aa  206  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 
234 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0924  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.34 
 
 
231 aa  204  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.32 
 
 
235 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 
231 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
227 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
221 aa  203  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.43 
 
 
229 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.22 
 
 
228 aa  203  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.28 
 
 
219 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
221 aa  202  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.01 
 
 
216 aa  201  8e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 
224 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  50.99 
 
 
224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.27 
 
 
219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
220 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.72 
 
 
223 aa  199  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.22 
 
 
218 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.72 
 
 
221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 
221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.29 
 
 
227 aa  198  5e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
221 aa  198  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
221 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 
223 aa  197  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 
264 aa  197  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
238 aa  197  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.98 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.5 
 
 
222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2395  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.05 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.26 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.76 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
214 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
217 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 
214 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
221 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.83 
 
 
235 aa  195  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.09 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 
217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3121  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.58 
 
 
241 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.798582  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.02 
 
 
232 aa  194  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2879  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 
242 aa  194  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.403873  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.17 
 
 
215 aa  194  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  47.42 
 
 
265 aa  194  8.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 
214 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2230  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
227 aa  194  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.375841  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
224 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 
214 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0651  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.41 
 
 
221 aa  194  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.77 
 
 
223 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 
221 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.64 
 
 
233 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2756  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
241 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0163  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.61 
 
 
241 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.468376  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.3 
 
 
224 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 
221 aa  192  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.12 
 
 
220 aa  191  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.54 
 
 
236 aa  191  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
223 aa  191  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1653  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
217 aa  191  8e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.123054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.19 
 
 
225 aa  190  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 
220 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1649  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.21 
 
 
221 aa  191  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.96 
 
 
243 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.28 
 
 
230 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 
221 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
228 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.26 
 
 
225 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3176  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.27 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.5 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0481  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.91 
 
 
223 aa  189  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
228 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.12 
 
 
223 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5109  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.6 
 
 
215 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0277689  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 
221 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>