More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2395 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2395  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
221 aa  450  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  71.03 
 
 
217 aa  311  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.51 
 
 
222 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0977  Ribulose-phosphate 3-epimerase  68.54 
 
 
219 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213833 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.61 
 
 
225 aa  288  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0481  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.99 
 
 
242 aa  251  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.05 
 
 
218 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.77 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 
217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.04 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.8 
 
 
217 aa  230  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.71 
 
 
221 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.71 
 
 
221 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.54 
 
 
211 aa  226  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.55 
 
 
236 aa  224  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.53 
 
 
224 aa  222  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2597  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 
209 aa  221  4.9999999999999996e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.943131  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.62 
 
 
220 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.52 
 
 
220 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.73 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  57 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
221 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 
221 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.73 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.49 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.48 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.62 
 
 
220 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  47.73 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.61 
 
 
231 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.19 
 
 
221 aa  219  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.27 
 
 
238 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.98 
 
 
219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
218 aa  218  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0049  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
222 aa  218  7.999999999999999e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  48.33 
 
 
265 aa  217  8.999999999999998e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.62 
 
 
221 aa  216  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.12 
 
 
247 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.3 
 
 
235 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 
217 aa  216  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.19 
 
 
221 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.47 
 
 
221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.82 
 
 
235 aa  215  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.27 
 
 
235 aa  215  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.71 
 
 
221 aa  215  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.24 
 
 
223 aa  215  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.96 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.96 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.61 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.69 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.49 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.87 
 
 
224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.96 
 
 
221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.78 
 
 
219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.25 
 
 
221 aa  211  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.48 
 
 
229 aa  211  7e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1432  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.02 
 
 
220 aa  211  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.12 
 
 
218 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.99 
 
 
214 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.71 
 
 
219 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.4 
 
 
219 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
229 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.49 
 
 
214 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1281  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0082  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
228 aa  210  2e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.36 
 
 
264 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1306  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0153242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 
214 aa  208  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1911  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.26 
 
 
230 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.822201  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 
214 aa  208  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 
214 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 
214 aa  208  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 
214 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 
214 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 
214 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 
214 aa  208  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.51 
 
 
221 aa  207  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.08 
 
 
221 aa  207  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
223 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.22 
 
 
217 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.75 
 
 
230 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.85 
 
 
224 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.98 
 
 
221 aa  205  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.85 
 
 
236 aa  204  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 
224 aa  204  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.85 
 
 
221 aa  204  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.76 
 
 
224 aa  204  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.85 
 
 
225 aa  204  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0333  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.5 
 
 
216 aa  204  9e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.540612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.98 
 
 
214 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.73 
 
 
221 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
225 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 
219 aa  203  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.4 
 
 
224 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.05 
 
 
223 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.4 
 
 
224 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.4 
 
 
224 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0267  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.4 
 
 
222 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.137082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2292  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.76 
 
 
227 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>