More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1509 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1509  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
218 aa  442  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  71.56 
 
 
223 aa  314  6e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.696743  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1167  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  68.69 
 
 
217 aa  306  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000257786  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.22 
 
 
219 aa  258  3e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.71 
 
 
220 aa  255  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.42 
 
 
216 aa  252  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.62 
 
 
214 aa  248  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.49 
 
 
218 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
214 aa  247  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
214 aa  247  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
214 aa  247  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
214 aa  247  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
214 aa  247  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
214 aa  247  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
214 aa  247  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
214 aa  246  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.67 
 
 
214 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.67 
 
 
214 aa  244  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.24 
 
 
221 aa  241  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.4 
 
 
224 aa  238  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 
219 aa  232  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.88 
 
 
231 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.86 
 
 
220 aa  230  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.38 
 
 
218 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.33 
 
 
221 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 
215 aa  228  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.88 
 
 
216 aa  226  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.87 
 
 
247 aa  225  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1281  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 
214 aa  224  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1306  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 
214 aa  224  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0153242  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 
221 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.97 
 
 
219 aa  222  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0788  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 
214 aa  221  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.38 
 
 
221 aa  221  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.38 
 
 
221 aa  221  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 
221 aa  221  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.51 
 
 
211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.87 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.54 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 
223 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.54 
 
 
227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.89 
 
 
225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.87 
 
 
235 aa  218  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.62 
 
 
218 aa  217  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
217 aa  216  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.97 
 
 
230 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
224 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 
218 aa  215  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 
234 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 
234 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.21 
 
 
227 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.46 
 
 
238 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.67 
 
 
264 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.04 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
229 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 
224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.49 
 
 
235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0651  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.06 
 
 
221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 
229 aa  211  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.27 
 
 
221 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
222 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.88 
 
 
217 aa  211  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.74 
 
 
224 aa  211  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  50.23 
 
 
265 aa  210  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.31 
 
 
226 aa  210  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 
219 aa  210  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
221 aa  210  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.28 
 
 
223 aa  210  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  48.36 
 
 
217 aa  210  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 
232 aa  210  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
219 aa  209  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
223 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.87 
 
 
221 aa  209  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.92 
 
 
217 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
221 aa  208  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.83 
 
 
224 aa  208  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 
219 aa  208  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
223 aa  208  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 
223 aa  208  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.52 
 
 
220 aa  207  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.52 
 
 
227 aa  207  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 
221 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5109  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
215 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0277689  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 
224 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 
224 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.53 
 
 
225 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 
224 aa  206  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1664  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.84 
 
 
232 aa  206  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00014027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.87 
 
 
221 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0932  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.05 
 
 
227 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.49 
 
 
221 aa  205  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 
221 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 
224 aa  205  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.79 
 
 
225 aa  205  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0991  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.04 
 
 
234 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.459485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>