More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0501 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0501  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
215 aa  432  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0476  ribulose-phosphate 3-epimerase  99.07 
 
 
215 aa  427  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1488  ribulose-phosphate 3-epimerase  97.67 
 
 
215 aa  424  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1028  ribulose-phosphate 3-epimerase  80.93 
 
 
215 aa  364  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.198537  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0861  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.61 
 
 
213 aa  302  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0769  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.85 
 
 
213 aa  291  7e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1607  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
213 aa  258  7e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
213 aa  251  8.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
218 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
221 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.41 
 
 
230 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.95 
 
 
214 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  218  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  218  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.33 
 
 
229 aa  214  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 
224 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0746  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
228 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51 
 
 
224 aa  209  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.51 
 
 
226 aa  208  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
235 aa  208  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.45 
 
 
224 aa  207  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 
230 aa  207  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.73 
 
 
224 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
224 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
224 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 
228 aa  205  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
228 aa  205  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.28 
 
 
238 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.86 
 
 
236 aa  204  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.17 
 
 
235 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
220 aa  203  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
234 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
234 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
224 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.81 
 
 
247 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.7 
 
 
239 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0751  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.73 
 
 
224 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3028  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
234 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0136369  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
218 aa  201  8e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07910  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
224 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0415  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
255 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545723  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
227 aa  201  9e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.86 
 
 
235 aa  201  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0446  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.338349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0449  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 
211 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.77 
 
 
220 aa  199  3e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
231 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
228 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.24 
 
 
234 aa  198  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.38 
 
 
219 aa  198  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2786  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.06 
 
 
234 aa  198  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2492  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
223 aa  198  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
225 aa  198  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1981  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.27 
 
 
236 aa  197  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.564168  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.86 
 
 
224 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 
221 aa  197  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.86 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.21 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  46.19 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.86 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2472  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
223 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
230 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.03 
 
 
223 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
217 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
228 aa  196  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 
223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  41.43 
 
 
224 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
221 aa  194  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.38 
 
 
229 aa  194  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
223 aa  194  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
221 aa  194  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.93 
 
 
224 aa  194  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2230  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
227 aa  194  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.375841  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
218 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2582  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.53 
 
 
230 aa  193  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1715  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.93 
 
 
229 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
223 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>