More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0861 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0861  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
213 aa  423  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0769  ribulose-phosphate 3-epimerase  76.53 
 
 
213 aa  347  7e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1607  ribulose-phosphate 3-epimerase  71.83 
 
 
213 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1028  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.61 
 
 
215 aa  305  4.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.198537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0501  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.61 
 
 
215 aa  302  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0476  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.61 
 
 
215 aa  301  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1488  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.14 
 
 
215 aa  299  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.79 
 
 
213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.8 
 
 
229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 
214 aa  218  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 
214 aa  218  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 
214 aa  216  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
226 aa  215  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07910  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 
224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
214 aa  214  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0751  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 
224 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
220 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.8 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
228 aa  211  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.92 
 
 
224 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
230 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0746  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.92 
 
 
228 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
239 aa  208  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0415  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
255 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545723  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0446  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
224 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.338349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0449  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
224 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.73 
 
 
236 aa  208  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.17 
 
 
228 aa  207  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
224 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
247 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 
223 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
221 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
216 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2364  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.41 
 
 
229 aa  205  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2582  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.75 
 
 
230 aa  204  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
223 aa  204  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
218 aa  204  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2492  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
223 aa  203  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
223 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
234 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2879  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.62 
 
 
229 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
234 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
223 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2786  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
234 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 
224 aa  202  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
219 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
221 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
224 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2472  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.82 
 
 
232 aa  201  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
224 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
235 aa  201  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
235 aa  201  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
221 aa  201  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
221 aa  201  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
236 aa  201  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  201  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3028  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
234 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0136369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.08 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.33 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 
221 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
222 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4601  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2230  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.54 
 
 
227 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.375841  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3899  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.62 
 
 
228 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.98 
 
 
227 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
221 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1911  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
230 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.822201  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
227 aa  198  5e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
238 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
223 aa  198  5e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 
225 aa  198  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>