More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1607 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1607  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
213 aa  435  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase  73.71 
 
 
213 aa  323  8.000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0861  ribulose-phosphate 3-epimerase  71.83 
 
 
213 aa  321  4e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0769  ribulose-phosphate 3-epimerase  70.42 
 
 
213 aa  315  5e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1028  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 
215 aa  266  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.198537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0501  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0476  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
215 aa  264  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1488  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 
215 aa  262  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.72 
 
 
229 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.95 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.48 
 
 
214 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.43 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
214 aa  218  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.49 
 
 
230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
228 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.85 
 
 
224 aa  207  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 
235 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
221 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
221 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
221 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
223 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
224 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
236 aa  205  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
224 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
217 aa  205  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
230 aa  205  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 
234 aa  204  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 
234 aa  204  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
216 aa  204  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.17 
 
 
223 aa  204  9e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 
238 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 
228 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0746  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.92 
 
 
228 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
218 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.92 
 
 
224 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
247 aa  202  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
219 aa  202  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.73 
 
 
235 aa  202  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 
235 aa  202  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
224 aa  201  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
225 aa  201  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
225 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
225 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 
234 aa  200  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
219 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.01 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.33 
 
 
225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.01 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.01 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.28 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2492  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.01 
 
 
225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2230  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 
227 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.375841  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
221 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
223 aa  199  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4601  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07910  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
224 aa  198  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
224 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0751  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
224 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0659  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.17 
 
 
228 aa  197  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
223 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0415  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545723  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0446  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.338349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0449  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.29 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.34 
 
 
225 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 
224 aa  195  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
239 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2364  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.95 
 
 
229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
230 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
227 aa  194  6e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
228 aa  194  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
219 aa  194  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
223 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.86 
 
 
224 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00503  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 
239 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  44.34 
 
 
217 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2582  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.31 
 
 
230 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.92 
 
 
236 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0731  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
224 aa  193  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0365158  normal  0.685056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>