More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1507 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 220 aa  443  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 		 217 aa  231  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 217 aa  231  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 		 218 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.61 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.29 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  49.76 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.11 
 
 		 221 aa  228  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.98 
 
 		 232 aa  228  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.77 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.46 
 
 		 221 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.46 
 
 		 221 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.19 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 214 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.18 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.18 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.94 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.24 
 
 		 221 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.67 
 
 		 220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2075  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.83 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.38 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.48 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.53 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.76 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.23 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.51 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.13 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.13 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.18 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.08 
 
 		 221 aa  216  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.53 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.51 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.26 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.78 
 
 		 224 aa  215  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.04 
 
 		 217 aa  215  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2874  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.84 
 
 		 229 aa  214  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 		 228 aa  214  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1649  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.06 
 
 		 221 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.51 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.76 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.47 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  52.74 
 
 		 265 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.76 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.92 
 
 		 235 aa  211  7e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.05 
 
 		 224 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.05 
 
 		 224 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2597  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.77 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.943131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0924  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.53 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2472  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.49 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 		 216 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.85 
 
 		 243 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.52 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3176  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 223 aa  207  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 		 219 aa  207  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.22 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.51 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2364  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.5 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.5 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.34 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2879  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.31 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.03 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 		 230 aa  205  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.29 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1908  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000189819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.05 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.5 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.01 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.97 
 
 		 231 aa  204  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2756  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.52 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>