More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1908 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1908  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000189819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 
224 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5109  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.93 
 
 
215 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0277689  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  50.7 
 
 
217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1432  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0333  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.89 
 
 
216 aa  218  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.540612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
219 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.54 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.29 
 
 
218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.94 
 
 
219 aa  212  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1116  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.33 
 
 
220 aa  210  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1014  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.33 
 
 
220 aa  210  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.2 
 
 
230 aa  210  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 
218 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.79 
 
 
229 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
223 aa  208  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2057  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.79 
 
 
231 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.725106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 
224 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.58 
 
 
218 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 
220 aa  205  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.62 
 
 
232 aa  204  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.68 
 
 
221 aa  202  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.18 
 
 
234 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.18 
 
 
234 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.39 
 
 
221 aa  201  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.49 
 
 
221 aa  201  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.49 
 
 
221 aa  201  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.97 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.04 
 
 
220 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
220 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 
221 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.18 
 
 
235 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.06 
 
 
230 aa  198  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 
235 aa  197  9e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 
247 aa  197  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.89 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
217 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.05 
 
 
214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.05 
 
 
214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2292  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 
224 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 
224 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.3 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.05 
 
 
214 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.28 
 
 
221 aa  193  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.12 
 
 
221 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1525  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.67 
 
 
214 aa  193  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.16 
 
 
217 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  46.51 
 
 
265 aa  192  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0985  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.78 
 
 
212 aa  191  6e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.69 
 
 
215 aa  191  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47 
 
 
224 aa  191  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
221 aa  191  9e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.31 
 
 
264 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.8 
 
 
223 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 
224 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
222 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.05 
 
 
216 aa  189  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.19 
 
 
221 aa  188  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.12 
 
 
221 aa  188  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.51 
 
 
233 aa  188  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.31 
 
 
221 aa  188  5e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.49 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.95 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.78 
 
 
219 aa  187  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.89 
 
 
224 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.12 
 
 
231 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.12 
 
 
221 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.85 
 
 
221 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.76 
 
 
219 aa  185  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.74 
 
 
224 aa  184  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.08 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0651  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.6 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
223 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
223 aa  181  7e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
219 aa  181  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.78 
 
 
227 aa  181  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.72 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1664  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
232 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00014027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.67 
 
 
229 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1205  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.32 
 
 
211 aa  180  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1649  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.45 
 
 
221 aa  180  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  42.06 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.3 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.23 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1306  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.93 
 
 
214 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0153242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>