93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1000 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1000  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 288 aa  556  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.508503  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2585  ApbE-like lipoprotein  34.92 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.501359  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  31.65 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  32.05 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  31.68 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0906  ApbE family protein, putative  30.57 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00687299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3457  ApbE family protein, putative  30.57 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  26.69 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  29.71 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  29.71 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3383  ApbE family lipoprotein  30.05 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3580  ApbE family protein, putative  29.53 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  30.32 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  22.35 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0685  ApbE family lipoprotein  30.34 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0743531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  31.72 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  31.97 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  26.15 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  32.08 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  28.1 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  25.65 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  29.68 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  28.8 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  25.82 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  30 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  32.35 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  27.11 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  30.04 
 
 		 326 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.66 
 
 		 349 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  24.31 
 
 		 339 aa  52.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  27.85 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  26.95 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0922  ApbE family protein, putative  27.98 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767638  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  25.58 
 
 		 345 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4214  ApbE family lipoprotein  28.1 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0921  ApbE family protein, putative  27.98 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0949043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  26.99 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  33.88 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0957  ApbE family protein, putative  27.98 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.76647  normal  0.566735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  25.26 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  28.99 
 
 		 352 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  25.61 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  26.91 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  27.24 
 
 		 330 aa  49.3  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  29 
 
 		 287 aa  49.3  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  29.69 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  30.4 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  27.5 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  28.95 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2657  ApbE family protein, putative  29.71 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00549568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  29.83 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.75 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  27.6 
 
 		 355 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  21.86 
 
 		 342 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  30.56 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  27.24 
 
 		 331 aa  45.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  30.17 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  30.17 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 		 320 aa  45.8  0.0009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.99 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  34.08 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  33.94 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1886  ApbE family lipoprotein  29.72 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00789462  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1557  ApbE family lipoprotein  29.72 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  30.15 
 
 		 345 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  25.99 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  25.99 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  23.08 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0905  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  29.71 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  29.31 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0427  ApbE family lipoprotein  32.79 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127952  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  25.11 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  28.46 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  30.98 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  29.52 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1418  apbE family protein  21.99 
 
 		 375 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1090  ApbE family protein, putative  24.21 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  41.82 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  35.67 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.41 
 
 		 350 aa  42.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  29.14 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2280  ApbE family lipoprotein  34 
 
 		 372 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.506741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0611  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  31.46 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  29.93 
 
 		 345 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>